Karena itu jalan manusia berbeda: jika Anda ingin berjuang untuk kedamaian dan kesenangan spiritual, maka percayalah; jika Anda ingin menjadi penyembah kebenaran.
Nietzsche kemudian berkonsentrasi belajar filologi di bawah Profesor Friedrich Wilhelm Ritschl, yang ia ikuti ke Universitas Leipzig pada tahun 1865. Di sana ia menjadi teman dekat dengan sesama mahasiswa Erwin Rohde. Publikasi filologis pertama Nietzsche datang segera setelahnya.
Pada tahun 1865, Nietzsche mempelajari secara menyeluruh karya-karya Arthur Schopenhauer. Dia berutang minat filosofisnya untuk membaca The World as Will and Representation karya Schopenhauer dan kemudian mengakui  Schopenhauer adalah salah satu dari sedikit pemikir yang dia hormati dan dedikasikan esai "Schopenhauer sebagai Pendidik" dalam Meditasi Sebelum Waktu kepadanya.
Pada tahun 1866 ia membaca History of Materialism karya Friedrich Albert Lange. Deskripsi Lange tentang filsafat anti-materialis Kant, kebangkitan materialisme Eropa, meningkatnya minat Eropa pada sains, teori evolusi Charles Darwin, dan pemberontakan umum melawan tradisi dan otoritas sangat memukau Nietzsche. Nietzsche pada akhirnya akan berargumen  tidak mungkin menjelaskan evolusi akal estetis manusia.
Pada tahun 1867, Nietzsche mendaftar untuk layanan sukarela satu tahun dengan divisi artileri Prusia di Naumburg. Dia dianggap sebagai salah satu pembalap terbaik di antara rekan-rekannya yang direkrut, dan perwiranya memperkirakan  dia akan segera mencapai pangkat kapten.Â
Tetapi pada bulan Maret 1868, saat melompat ke pelana kudanya, Nietzsche memukul dadanya di bangku dan merobek dua otot di sisi kirinya, membuatnya kelelahan dan tidak bisa berjalan selama berbulan-bulan. Karena itu, ia kembali melanjutkan studinya, menyelesaikannya pada tahun 1868. Nietzsche  bertemu Richard Wagner untuk pertama kalinya di akhir tahun itu.
Dengan dukungan Ritschl, Nietzsche menerima tawaran pada tahun 1869 untuk menjadi profesor filologi klasik di Universitas Basel di Swiss. Dia baru berusia 24 tahun dan belum menyelesaikan disertasi atau menerima sertifikat mengajar ("habilitasi"). Pada bulan Maret 1869 ia dianugerahi gelar doktor kehormatan oleh Universitas Leipzig, sekali lagi dengan dukungan Ritschl.
Meskipun tawaran itu datang pada saat dia sedang mempertimbangkan untuk melepaskan filologi demi sains, dia menerimanya. Sampai hari ini, Nietzsche adalah salah satu profesor sastra klasik termuda.
Dalam tesis doktoral Nietzsche yang direncanakan dari tahun 1870, "Kontribusi terhadap Studi dan Kritik terhadap Sumber Diogenes Laertius" ("Beitrage zur Quellenkunde und Kritik des Laertius Diogenes"), asal-usul ide Diogenes Laertius diselidiki. Itu tidak pernah dikirimkan, tetapi kemudian diterbitkan sebagai catatan ucapan selamat di Basel.
Sebelum pindah ke Basel, Nietzsche melepaskan kewarganegaraan Prusianya: selama sisa hidupnya ia secara resmi tetap tanpa kewarganegaraan.
Namun, Nietzsche bertugas di pasukan Prusia selama Perang Prancis-Prusia (1870-1871) sebagai tenaga medis. Selama waktu singkatnya di militer, ia mengalami banyak dan menyaksikan efek traumatis dari pertempuran. Ia  menderita difteri dan disentri. Walter Kaufmann berspekulasi  ia mungkin  tertular sifilis di rumah bordil bersama dengan infeksi lainnya saat ini.Â
