Dalam hal ini PRKKP membentuk kelompok-kelompok riset yang menjadi wajah identitas khazanah keagamaan dan peradaban itu sendiri.Â
Kelompok Riset Agama dan Kearifan Bangsa
Kelompok riset ini terutama akan melakukan kajian: Agama dan Kearifan Lokal dalam Tantangan Global, Tradisi Keagamaan, Kearifan kepariwisataan religi nusantara, dan keadilan Gender.
Program riset yang akan dikembangkan antara lain: Penelitian tentang Kearifan lokal dan Kearifan global keagamaan, Tradisi dan Ritual Keagamaan, Pengembangan Wisata Religi dan Keadilan Gender Berbasis Keagamaan,.
Kelompok Riset Khazanah Keagamaan
Kelompok riset ini akan melakukan kajian antara lain : Arsitektur Keagamaan Klasik dan Kontemporer, Bahasa dan Sastra Keagamaan, Seni dan Budaya Keagamaan
Program riset yang akan dikembangkan antara lain: penelitian tentang Arsitektur keagamaan, penelitian kebahasaan, kesastraan dan budaya keagamaan, Khazanah keagamaan, dan jaringan kekerabatan nusantara.Â
Kelompok Riset Peradaban Masyarakat
Kelompok riset ini, diantaranya akan melakukan kajian: Peradaban Masyarakat dan Ketahanan bangsa, Agama dan Pemajuan Kebudayaan dan Sistem Pengetahuan Masyarakat.Â
Sedangkan Program riset yang akan dikembangkan antara lain: penelitian tentang peradaban masyarakat lampau dan masa kini, peradaban digital, penelitian tentang adaptasi objek pemajuan kebudayaan dengan agama, serta sistem budaya masyarakat berkelanjutanÂ
Kelompok Riset Sejarah Agama dan Multikulturalisme