Konsep pendidikan yang di miliki oleh syekh az-Zarnuji telah beliau  tuangkan dalam karyanya yaitu kitab Ta'lim al-Muta'alim. Yang di dalamnya membahas beberapa factor pendidikan yang meliputi:
1. Factor tujuan pendidikan
Dalam fasal 2 kitab Ta'lim al-Muta'alim syekh az-Zarnuji membahas tentang niat ketika belajar, dimana seorang pelajar hendaknya berniat mencari ridho Allah SWT dalam proses belajarnya, selain itu pelajar juga harus berniat untuk menghilangkan kebodohan, menghidupkan ajaran agama dan berniat mencari kebahagiaan di akhirat kelak.
2. Factor terdidik
Dalam mencari ilmu seorang pelajar harus memiliki sifat moral yang mulia. Diantaranya:
a. Tawadhu', tidak sombong, dan tidak rendah diri.
Iffah, (menjaga kehormatan diri).
b. Sabar dalam menghadapi ujian yang ada ketika proses belajar.
c. Tabah dalam menghadapi kesulitan dalam proses belajar.
d. Cinta ilmu serta hormat kepada guru dan keluarga.
e. Sayang kepada kitab, menaruhnya pada tempat yang layak.
f. Saling menghormati antar sesama pelajar.
Memanfaatkan waktu belajar dengan sungguh-sungguh.
g. Konsisten dalam menuntut ilmu.
h. Wara'(menahan diri sifat tercela).
Memiliki cita-cita dalam perjalanan mencari ilmunya.
