c. Periode Penjajahan Jepang
Jepang menguasai Indonesia pada tahun 1942, Pada mulanya, jepang masuk ke Indonesia tidak menunjukkan kesadisannya akan tetapi mendukung Indonesia dalam mendirikan pesantren.
Namun, sikap yang dilakukan jepang hanya kamuflase atau tipu daya, Jepang malah menjajah Indonesia secara psikis nya membuat Indonesia semakin bodoh. Sikap dan kepeduliannya kepada Indonesia hanya siasat semata untuk menghancurkan Indonesia.
Jepang menarik simpati orang islam dengan menerapkan kebijakan yaitu membangun Kantor Urusan Agama (KUA), para pembesar jepang sering membantu pondok pesantren besar yang ada di Indonesia, jepang memasukkan ajaran-ajaran yang identic dengan ajaran agama pada sekolah negeri, jepang memberikan kelonggaran kepada islam untuk mengurus organisasi islam.
Hal itu tidak bertahan lama, karena ada desakan sekutu jepang bukan malah mendukung tapi berbuat semena-mena dan lebih kejam yaitu dengan memberhentikan seluruh kegiatan pendidikan. Sekolah dirubah dengan kegiatan baris berbaris dan latihan militer.
d. Periode Pesantren Pasca Kemerdekaan
Setelah merdeka dari penjajahan Belanda dan juga Jepang, para pemuka Negara memulihkan kembali mengembangkan pendidikan sesuai dengan kebudayaan Indonesia. Pondok pesantren mendapatkan kebebasan dan menghidupkan misinya untuk lebih eksis dan berbenah diri untuk meningkatkan daya saing.
Pemerintah Indonesia meminta pondok pesantren dengan menerapkan system madrasah.akantetapi di tolak karena para pemuka pesantren curiga karena madrasah merupakan sesuatu yang menyerupai hal yang diterapkan belanda dan jepang.
Pada tahun 70-an , terjadi perubahan yang signifikan yaitu pesantren mengalami perkembangan yang menakjubkan disemua wilayah, pada penyelenggaran pendidikan lebih sistematis.
Pada era ini, pesantren mulai memasukkan pelajaran formal agar menambah wawasan santri, ada juga yang memasukkan bahasa asing dalam kurikulum pesantren, memperbarui system klasikal dalam pengajarannya. Jadi, pesantren akan menghasilkan pendidikan yang unggul dan dibanggakan.
3. Hakikat dan Tujuan Pesantren
