Dengan demikian, pengembangan bahan baku berkualitas rendah untuk proses enzimatik memiliki potensi besar.
Tantangan utama lainnya untuk proses enzimatik adalah menghasilkan produk biodiesel akhir yang memenuhi standar. Desain reaktor memainkan peran penting dalam mempromosikan kesetimbangan reaksi esterifikasi dan transesterifikasi untuk mewujudkan konversi bahan baku minyak secara menyeluruh.
Oleh karena itu perlu diungkapkan  kemajuan yang dicapai dalam proses produksi biodiesel enzimatik, terutama berfokus pada pengurangan biaya enzim, perluasan bahan baku berkualitas rendah, dan desain reaktor baru.
 Peningkatan Proses Produksi Biodiesel Enzimatik
Dibandingkan dengan proses alkali konvensional, keuntungan terbesar dari proses enzimatik adalah dapat secara efisien menggunakan bahan baku yang murah dan berkualitas rendah dengan kandungan asam lemak bebas yang tinggi, yang secara signifikan akan mengurangi total biaya produksi.
Dengan demikian, pengembangan bahan baku berkualitas rendah untuk proses enzimatik memiliki potensi besar. Tantangan utama lainnya untuk proses enzimatik adalah menghasilkan produk biodiesel akhir yang memenuhi standar.
Desain reaktor memainkan peran penting dalam mempromosikan kesetimbangan reaksi esterifikasi dan transesterifikasi untuk mewujudkan konversi bahan baku minyak secara menyeluruh
Lipase banyak digunakan sebagai biokatalisator untuk mengkatalisis reaksi hidrolisis dan esterifikasi serta transesterifikasi. Meskipun pembuatan biodiesel yang dimediasi oleh lipase telah diteliti secara ekstensif, biaya lipase masih relatif tinggi dibandingkan dengan katalis kimia, terutama untuk lipase amobil.
Penelitian yang signifikan telah dilakukan untuk mengurangi biaya enzim, seperti mengeksplorasi produksi lipase baru dari berbagai mikroorganisme, modifikasi lipase, dan menyelidiki perbaikan pada persiapan lipase. Lipase telah berhasil dimodifikasi dengan peningkatan aktivitas katalitik dan toleransi terhadap metanol dan suhu tinggi melalui penggunaan bioteknologi  modern.
Kinerja lipase, termasuk aktivitas katalitik dan stabilitas, ditingkatkan untuk sebagian besar oleh rekayasa protein dan berbagai pendekatan imobilisasi enzim,
 Proses Katalis Lipase  bebasÂ
