1. Alat-alat yang diperlukan dalam kegiatan eksperimen tidak tersedia dalam jumlah yang cukup sehingga tidak setiap anak didik memperoleh kesempatan untuk melakukan eksperimen.
2. Jika eksperimen memerlukan proses hasil dengan jangka waktu yang lama, proses eksperimen yang kadang berlangsung lama membuat anak harus menunggu.
3. Kebanyakan metode ini hanya cocok untuk konsep/ilmu alam dan teknologi.
4. Metode ini memerlukan alat, fasilitas, dan bahan yang lengkap sehingga jika salah satu alatnya kurang, eksperimen akan berjalan kurang baik atau bahkan gagal.
5. Faktor keselamatan kerja perlu diperhitungkan dengan matang, terutama pada eksperimen yang menggunaan cairan kimia.
6. Apabila pendidik belum cukup pengalaman, kemungkinan hasilnya tidak sesuai harapan.
7. Â Eksperimen yang memerlukan waktu panjang tidak praktis.
4. Bentuk-bentuk Eksperimen.
a. berdasarkan struktur kegiatan
    1. Formal
Eksperimen formal adalah eksperimen yang direncanakan oleh pendidik. Tujuan aktivitas ini adalah mengembangkan kemampuan anak dalam mengamati