Virus Corona Bermutasi, Apa Pengaruhnya terhadap Vaksin?

Saat kita memasuki tahun kedua hidup dengan SARS-CoV-2, virus ini pun sedang merayakan invasinya ke populasi dunia dengan lebih banyak bentuk mutasi, yang membantunya menyebar lebih mudah dari orang ke orang.

Pertama kali terdeteksi di Inggris pada bulan Desember, mutasi virus ini telah menimbulkan kekhawatiran tentang apakah virus COVID-19 sekarang mampu meloloskan diri dari perlindungan yang mungkin diberikan oleh vaksin yang baru saja diluncurkan. Pejabat Inggris telah memperketat penguncian di Inggris, Skotlandia, dan Wales. 

Varian baru dari SARS-CoV-2 ini juga telah ditemukan di AS. Selama musim liburan terakhir, lebih dari 40 negara melarang pelancong dari wilayah tersebut dalam upaya untuk menjaga agar varian baru tersebut tidak menyebar ke daerah lain di dunia. 

Pejabat kesehatan juga prihatin tentang jenis berbeda yang ditemukan di Afrika Selatan yang bisa saja lebih kebal terhadap perlindungan vaksin. Varian ini mencakup beberapa mutasi di area utama virus yang menjadi target antibodi yang dihasilkan oleh vaksin.

Di Indonesia, mutasi virus yang dinamakan B.1.17 muncul pada September 2020 sedangkan larangan masuknya WNA baru diterapkan pada 1 Januari.

Adanya jeda waktu 3-4 bulan tersebut menjadi alasan Riza Arief Putranto, peneliti genomik molekuler dari Aligning Bioinformatics dan anggota konsorsium Covid-19 Genomics UK, menilai kebijakan pelarangan masuk WNA tak cukup untuk mencegah masuknya mutasi virus corona tersebut. Bisa saja selama jeda tersebut, ada orang yang bepergian dari Inggris masuk ke Indonesia dan terinveksi virus tersebut.

"Saat ini penting untuk memikirkan mitigasinya, bukan hanya pencegahannya," katanya.

Seperti halnya yang kita lakukan saat serangan pertama Covid-19, sekarang sangat penting untuk menjawab (kembali) pertanyaan-pertanyaan seperti: Bagaimana tepatnya varian baru tersebut memengaruhi orang yang terinfeksi? Seperti apakah mutasi corona ini mengembangkan gejala yang lebih parah? dan apakah dapat menyebabkan lebih banyak rawat inap dan kematian?

Masih belum jelas, tapi pertanyaan-pertanyaan ini telah meningkatkan upaya para ilmuwan untuk mengurutkan lebih banyak sampel secara genetik dari pasien yang terinfeksi untuk mempelajari seberapa luas variannya. Sejauh ini, ada cukup banyak petunjuk yang membuat para pakar kesehatan masyarakat khawatir.

Fakta bahwa SARS-CoV-2 berubah menjadi strain yang berpotensi lebih berbahaya bukanlah suatu kejutan. Virus bermutasi. Mereka harus, untuk menebus kesalahan kritis dalam bentuk lama mereka. Seperti manusia dan makhluk hidup lainnya, virus pun punya sistem pertahanan yang memungkinkan spesiesnya bertahan. 

Salah satunya melalui mutasi, namun tidak seperti patogen lain seperti bakteri, jamur, dan parasit, virus tidak memiliki mesin yang diperlukan untuk membuat lebih banyak salinan dari dirinya sendiri, sehingga virus tidak dapat berkembang biak sendiri. Mereka bergantung sepenuhnya pada pembajakan alat reproduksi dari sel yang mereka infeksi untuk menghasilkan keturunan.

Menjadi penumpang gelap berarti virus tidak bisa pilih-pilih host, dan harus puas dengan perangkat selular apa pun yang dapat mereka temukan, dalam hal ini sel inang. Hal itu biasanya mengarah pada kesibukan saat mereka menyelinap untuk menyalin kode genetiknya; Akibatnya, virus memiliki genom paling sembrono di antara mikroba. Sebagian besar kesalahan ini tidak ada artinya dan kebanyakan merupakan jalan buntu bagi perkembangan mereka dan tidak berdampak pada manusia.

Tetapi karena lebih banyak kesalahan dibuat, kemungkinan perangkat selular seseorang akan menjadi mesin pencetak varian baru yang membuat virus tersebut lebih baik dalam berpindah dari satu orang ke orang lain, atau mengeluarkan lebih banyak salinan dari dirinya. Sekali menemukan perangkat sel yang cocok, jumlah virus akan meningkat secara dramatis dalam populasi manusia.

Untungnya, SARS-CoV-2  menemukan perangkat selular yang cocok ini lebih lambat daripada sepupu mereka seperti influenza dan HIV. Para ilmuwan yang mengurutkan ribuan sampel SARS-CoV-2 dari pasien COVID-19 menemukan bahwa virus tersebut membuat sekitar dua kesalahan dalam sebulan. Namun, sejauh ini hal itu menyebabkan sekitar 12.000 mutasi (yang diketahui) pada SARS-CoV-2, menurut GISAID, basis data genetik publik dari virus tersebut. Dan beberapa, secara kebetulan, akhirnya menciptakan ancaman kesehatan masyarakat yang lebih besar.

Hanya beberapa bulan setelah SARS-CoV-2 diidentifikasi di China Januari lalu, misalnya, varian baru, yang disebut D614G, menggantikan strain aslinya. Versi baru ini menjadi yang dominan yang menginfeksi sebagian besar Eropa, Amerika Utara dan Amerika Selatan. 

Pakar virus masih tidak yakin tentang seberapa penting D614G, yang dinamai dari lokasi mutasi pada genom virus, dalam hal penyakit manusia. Namun sejauh ini, sampel darah dari orang yang terinfeksi strain tersebut menunjukkan bahwa virus tersebut masih dapat dinetralkan oleh sistem kekebalan tubuh. 

Itu berarti bahwa vaksin yang saat ini sedang diluncurkan di seluruh dunia juga dapat melindungi dari jenis ini, karena suntikan dirancang untuk menghasilkan tanggapan kekebalan yang serupa di dalam tubuh. "Jika publik khawatir tentang apakah kekebalan vaksin dapat menutupi varian ini, jawabannya adalah ya," kata Ralph Baric, profesor atau epidemiologi, mikrobiologi dan imunologi di University of North Carolina Chapel Hill, yang telah mempelajari virus corona untuk beberapa dekade.

Yang disebut varian N501Y (beberapa pejabat kesehatan juga menyebutnya B.1.1.7.), yang baru-baru ini bikin berita di Indonesia, mungkin lain ceritanya. 

Para peneliti yakin jenis ini dapat menyebar lebih mudah di antara manusia. Tidak mengherankan, karena hingga saat ini, sebagian besar penduduk dunia belum terpapar SARS-CoV-2. 

Artinya untuk saat ini, varian yang lebih baik dalam berpindah dari satu orang ke orang lain akan memiliki keuntungan dalam menyebarkan kode genetiknya. Tapi karena semakin banyak orang yang divaksinasi dan dilindungi dari virus, hal itu mungkin berubah.

Kondisi seleksi untuk evolusi virus sekarang mendukung penularan cepat, tetapi karena semakin banyak populasi manusia menjadi kebal, tekanan seleksi berubah. Dan peneliti masih belum dapat memprediksi dengan jelas tentang apa yang akan terjadi dengan varian ini ke depannya.

Dalam skenario terburuk, perubahan tersebut dapat mendorong virus menjadi resisten terhadap sel kekebalan yang dihasilkan oleh vaksin yang tersedia saat ini. 

Mutan saat ini adalah upaya pertama virus untuk memaksimalkan kooptasi populasi manusia sebagai mesin penyalin virus. Tetapi mereka juga bisa berfungsi sebagai tulang punggung di mana SARS-CoV-2 membangun resistensi terhadap antibody yang dihasilkan vaksin, yang lebih berkelanjutan dan stabil. 

Seperti seorang narapidana yang merencanakan pembobolan penjara, virus menunggu waktu yang tepat, lalu mengikis pertahanan yang telah dibangun oleh sistem kekebalan manusia. 

Misalnya, virus dapat bermutasi dengan cara yang mengubah susunan protein lonjakannya yang merupakan bagian dari virus yang menjadi pintu masuk antibodi kita untuk menempel dan menetralkan virus. Dan satu mutasi itu mungkin tidak cukup untuk melindungi virus dari antibodi tersebut. Tapi kemungkinan dalam dua atau tiga mutasi, hal itu bisa saja terjadi.

Kekhawatiran terbesar saat ini, adalah bahwa sudah ada dua atau tiga varian SARS-CoV-2 yang punya mutasi di pintu masuk antibodi tersebut, "di mana mutasi tambahan bisa bikin perubahan yang lebih signifikan dalam hal penularan atau virulensi." kata Baric. 

Cara terbaik untuk memantau evolusi virus tersebut adalah dengan mengurutkan virus pada sebanyak mungkin orang yang terinfeksi, sesering mungkin. Hanya dengan melacak bagaimana SARS-CoV-2 berubah, para ilmuwan dapat berharap untuk tetap berada di depan dari mutasi yang paling berbahaya dan berpotensi lebih mematikan. 

Pada bulan November, Pusat Pengendalian Penyakit AS (CDC) meluncurkan program pengurutan yang akan meminta setiap negara bagian untuk mengirim 10 sampel setiap minggu dari orang yang telah terinfeksi, untuk lebih konsisten melacak setiap perubahan pada SARS-CoV-2. genom. "Program tersebut merupakan program sukarela, masih bukan upaya nasional, dan tidak ada dana khusus untuk itu," kata Baric. 

Tanpa dana federal yang besar yang didedikasikan khusus untuk mengurutkan genom SARS-CoV-2, sebagian besar pekerjaan di AS saat ini dilakukan oleh para ilmuwan di pusat akademik seperti Broad Institute of MIT dan Harvard dan University of Washington. 

Sejak awal tahun lalu, CDC telah bekerja untuk mengkarakterisasi virus SARS-CoV-2 dengan lebih baik dari sampel pasien. CDC (Pusat Pengendalian dan Pencegahan Penyakit) bermitra dengan beberapa laboratorium akademis universitas, serta departemen kesehatan negara bagian dan lokal serta perusahaan diagnostik komersial, dalam kerja sama yang bernama Konsorium SARS-CoV-2 Sequencing for Public Health Emergency Response, Epidemiology and Surveillance (SPHERES). "Jika kami mengurutkan satu dari 200 kasus, maka kami kehilangan banyak informasi. Jika kami mengurutkan sekitar 20% kasus, maka kami mungkin mulai melihat sesuatu dan kami akan berada di permainan bola untuk menemukan varian baru. Kami mungkin bisa melakukannya dengan lebih baik." kata Baric.

Negara lain juga sedang mengupayakan upaya ini. Inggris telah lama menjadi pemimpin dalam pengurutan genetik, dan kemungkinan besar karena upaya mereka mampu mengidentifikasi varian baru secara relatif cepat setelah muncul. Secara global, para ilmuwan juga telah memposting urutan genetik dari SARS-CoV-2 ke database GISAID publik.

Negara lain juga sedang mengupayakan upaya ini. Inggris telah lama menjadi pemimpin dalam pengurutan genetik, dan kemungkinan besar karena upaya mereka mampu mengidentifikasi varian baru relatif cepat setelah muncul. Secara global, para ilmuwan juga telah memposting urutan genetik dari SARS-CoV-2 ke database GISAID publik.

Di Indonesia, Wakil Kepala Lembaga Biologi Molekuler Eijkman Herawati Supolo Sudoyo dan timnya sedang melakukan pengawasan terhadap genom baru dari virus ini. Namun, sejauh ini surveilans genomik yang dilakukan dinilai masih sangat minim, bisa jadi virus baru ini sudah menyebar di Indonesia namun  belum terdeteksi.

Seperti yang dilansir dari KOMPAS, "Sejauh ini Eijkman telah melakukan analisis WGS 40 genom, dan menargetkan melakukan analisis terhadap 1.000 spesimen," kata Herawati. Ia juga mengatakan, Kementerian Kesehatan berencana meningkatkan kapasitas surveilans genomik ini dengan menggandeng sejumlah laboratorium di bawah Litbang Kementerian Kesehatan. Sementara Eijkman dan sejumlah laboratorium molekuler perguruan tinggi di bawah koordinasi Kementerian Riset dan Teknologi.

Varian baru B.1.1.7 ini diketahui memiliki kemampuan lebih menular hingga 70 persen dibandingkan dengan varian awal SARS-CoV-2 yang ditemukan di Wuhan, China. Pemberian vaksin sudah di depan mata, tapi kita masih harus beranggapan bahwa mutasi virus yang kemungkinan lebih ganas ini sedang mengintai di sekeliling kita. Untuk itu, sebagai warga Indonesia (dan dunia), sudah menjadi keharusan bagi kita untuk ikut memerangi varian baru ini dengan lebih mematuhi protokol kesehatan untuk Covid-19 dari sebelumnya.

Salam sehat selalu.

Sumber penulisan :

KOMPAS

TIME

GOV.UK

BBC

NBC