Jika penelitian ini dikonfirmasi, itu tidak akan membuktikan penyebab genetik untuk homoseksualitas.
Pemeriksaan lebih dekat akan mengungkapkan  gen dapat mempengaruhi semua kualitas, misalnya karakteristik kemiripan fisik dengan ibu, temperamen atau misalnya kecenderungan untuk takut, dll. Dapat diasumsikan  beberapa ibu atau ayah membesarkan anak laki-laki dengan sifat seperti itu di lingkungan yang kurang maskulin, atau  anak laki-laki dengan gen seperti itu rentan terhadap maladaptasi dalam kelompok sebaya dengan jenis kelamin yang sama (jika, misalnya, gen dikaitkan dengan takut). Dengan demikian, gen itu sendiri tidak dapat menentukan. Tidak mungkin hal itu dapat dikaitkan dengan seksualitas seperti itu,
William Byne (1994) mengajukan pertanyaan menarik lainnya. Kesamaan antara anak laki-laki gay dan ibu mereka dalam urutan molekuler dari kromosom X yang dipelajari, ia mencatat, tidak berarti gen yang sama adalah sama untuk semua pria ini, karena tidak terungkap  dalam semua kasus urutan molekul yang sama. (Sepasang saudara laki-laki memiliki warna mata yang sama dengan ibu mereka; yang lain memiliki bentuk hidung, dll.)
Dengan demikian, keberadaan gen homoseksualitas tidak nyata karena dua alasan: 1) dalam keluarga homoseksual tidak ditemukan faktor keturunan Mendel; 2) hasil studi si kembar lebih konsisten dengan teori lingkungan eksternal dibandingkan dengan penjelasan genetik.
Mari kita jelaskan yang kedua. Hal-hal aneh terungkap di sini. Kembali pada tahun 1952, Kallmann melaporkan , menurut penelitiannya, 100% kembar identik, salah satunya gay, saudara kembarnya juga gay. Dan kembar fraternal, hanya 11% dari saudara laki-laki yang sama-sama homoseksual.
Namun, ternyata, penelitian Kallmann bias dan tidak representatif, dan segera menjadi jelas  ada banyak heteroseksual di antara kembar identik. Sebagai contoh, Bailey dan Pillard (1991) menemukan kebetulan homoseksual hanya pada 52% dari kembar identik laki-laki dan 22% dari saudara kembar, sedangkan saudara homoseksual ditemukan pada 9% dari non-kembar homoseksual, dan 11% memiliki saudara angkat homoseksual! Dalam hal ini, pertama, dapatkah faktor genetik yang berhubungan dengan homoseksualitas menjadi penentu hanya dalam separuh kasus, sehingga itu bukanlah penyebab yang menentukan.
Kedua: perbedaan antara saudara kembar, di satu sisi, dan homoseksual pada saudara laki-laki mereka (termasuk anak angkat), di sisi lain (masing-masing 22%, 9% dan 11%), menunjukkan alasan non-genetik, karena saudara laki-laki juga memiliki anak kembar yang sangat berbeda dari semua keluarga lainnya. Dengan demikian, penjelasan untuk hubungan yang diamati tidak harus dicari dalam genetika tetapi dalam psikologi. karena saudara kembar juga sangat dibedakan dari keluarga lainnya.
Dengan demikian, penjelasan untuk hubungan yang diamati tidak harus dicari dalam genetika tetapi dalam psikologi. karena saudara kembar juga sangat dibedakan dari keluarga lainnya. Â
Ada kontroversi lain, misalnya, penelitian lain menunjukkan kecocokan homoseksual yang lebih rendah pada kembar identik, dan sampel dari sebagian besar penelitian tidak mewakili seluruh populasi homoseksual.
Tetapi kembali ke studi Hamer: terlalu dini untuk menarik kesimpulan darinya tentang adanya faktor genetik, karena antara lain kita tidak tahu apakah "gen" teoretis ini ada pada saudara laki-laki homoseksual heteroseksual dalam populasi heteroseksual . Kritik paling fatal untuk penelitian ini disuarakan oleh Rish, yang meneliti teknik sampel Hammer. Menurut Rish, hasil statistik Hamer tidak memiliki hak untuk menarik kesimpulan apapun dari Hamer (Rish et al. 1993).
Terlepas dari kenyataan  Hamer sendiri mengatakan  penelitiannya mengusulkan "pengaruh genetik", ia tetap mengklaim "kemungkinan penyebab eksternal" homoseksualitas (Hamer et al. 1993). Masalahnya adalah  "prasyarat" tersebut dinyatakan hampir terbukti.
