Benda-benda fisik mengandung materi sebagai elemen esensial, dan, jika materi mereka bukan bagian dari apa yang diketahui, maka tampaknya pengetahuan manusia tidak lengkap. Untuk mengatasi kekhawatiran itu, Aquinas merevisi teori Aristotle untuk mengatakan  tidak hanya bentuk tetapi  " spesies "dari suatu objek ada di akal.Â
Spesies adalah kombinasi bentuk dan sesuatu seperti ide umum materi, yang disebut Aquinas " common matter. "Common matter dikontraskan dengan" materi yang diindividuasikan, "yang merupakan hal-hal yang merupakan bagian fisik dari suatu objek.
Alah satu keberatan terhadap teori ini adalah  kelihatannya mengikuti dari situ  objek-objek pengetahuan manusia adalah ide daripada benda. Yaitu, jika mengetahui sesuatu terdiri dari memiliki bentuk dan spesies dalam kecerdasan seseorang, maka tampak  bentuk dan spesies, bukan benda, adalah apa yang diketahui. Jadi, mungkin terlihat  pandangan Aquinas adalah tipe idealisme .
Aquinas mengantisipasi kritik semacam itu dengan berbagai cara. Karena itu termasuk gagasan tentang materi, spesies suatu objek tampaknya lebih mirip objek itu sendiri daripada bentuk Aristotelian imaterial. Terlebih lagi, bagi ilmu pengetahuan Aquinas tidak bertujuan untuk mengetahui objek tertentu, tetapi lebih pada mengetahui apa yang umum untuk semua objek dari jenis tertentu. Dalam hal itu, pandangan Aquinas serupa dengan pandangan para ilmuwan modern. Sebagai contoh, bola biliar tertentu yang dijatuhkan Smith dari jendelanya tidak menjadi perhatian langsung pada fisika . Yang menarik para fisikawan adalah hukum yang mengatur perilaku benda jatuh.
Meskipun pertimbangan seperti itu mungkin mereda , mereka tidak menumpulkan kekuatan utama keberatan. Untuk memenuhi hal itu, Aquinas memperkenalkan perbedaan antara apa yang diketahui dan apa yang diketahui. Untuk menentukan apa yang diketahui katakanlah, seekor anjing perorangan adalah untuk menentukan objek pengetahuan.Â
Untuk menentukan  dengan apa yang diketahui diketahui katakanlah, gambar atau spesies anjing adalah untuk menentukan aparatus pengetahuan. Dengan demikian, spesies dari sesuatu yang diketahui itu sendiri bukanlah objek pengetahuan, meskipun ia dapat menjadi objek pengetahuan dengan direfleksikan.
Pada pengetahuan tentang kebenaran; Seperti filsuf mana pun, pada mulanya Thomas mengajukan pertanyaan: dari mana pengetahuan manusia berasal, bagaimana cara kerjanya dan apa itu kebenaran? Dia menunjukkan cara dalam epistemologinya. Dimulai sebagai [1] Rasa pengetahuan. Melalui indranya manusia memperoleh gambaran tentang hal-hal dari dunia luar. [2] pengetahuan intelektual.Â
Orang seharusnya tidak hanya melihat gambar ini, tetapi  memahaminya. Ini dilakukan melalui pikiran, yang dengannya seseorang dapat memahami esensi sesuatu. Pikiran mengabstraksi fitur-fitur untuk memahami esensi mereka. [3] pengetahuan rasional. Segala sesuatu dipahami oleh pikiran dan keberadaannya menjadi jawaban atas apa. Penyebabnya diselidiki: penyebab bahan (bagian atas meja terbuat dari kayu), penyebab bentuk (bagian atas meja berbentuk persegi panjang), penyebab tindakan (bagian atas meja dibuat oleh tukang kayu) dan tujuan tugas (untuk apa meja itu?).
Akhirnya, muncul pertanyaan: dari mana asal penyebab ini, apa penyebab pertama? Thomas Aquinas menyadari  penyebab pertama adalah selalu Menjadi. Wujud selalu merupakan awal dari segala sesuatu. Sekarang pertanyaan tentang kebenaran  bisa dijawab. Kebenaran diberikan ketika pengetahuan tentang pemahaman, intelek, setuju dengan hal itu (adaequatio intellectus et rei). Thomas mengambil doktrin ini dari Neo-Platonnis Isaac ben Salomon Israel, yang hidup dari 840/850 hingga 942.
Namun, Thomas  mengakui  pengetahuan manusia memiliki keterbatasan. Meskipun manusia membutuhkan alasan untuk percaya, ia dapat memahami, tetapi tidak menjelaskan, hal-hal supernatural, mereka tetap menjadi rahasia. Misalnya, Tritunggal Allah, Perawan Maria, atau Kebangkitan. Untuk kebenaran iman supernatural ini, pengetahuan diberikan kepada manusia, misalnya melalui wahyu Allah atau kesaksian para rasul.
Pertanyaan tentang keberadaan Tuhan dikuasai oleh Thomas Aquinas. Dia menunjuk lima cara spiritual dan filosofis yang mungkin, tanpa bukti, yang melaluinya manusia dapat mengenali Tuhan. Berikut adalah dua cara yang dapat menuntun kepada Allah melalui kausalitas dan tujuan: [1] Pengalaman kami menunjukkan  semua hal tergantung pada penyebab sebelumnya. Namun, harus ada penyebab pertama, penyebab absolut. Ini harus terlepas dari suatu sebab dan dia memanggil Thomas God. Seseorang  berbicara tentang bukti darurat. [2] Pengalaman menunjukkan  kosmos memiliki urutan hukum alam. Sistem ini mengarah ke satu kesatuan, ke alam semesta. Tapi dari mana datangnya persatuan ini? Bukan dari kosmos itu sendiri, karena tidak ada substansi spiritual. Akibatnya, harus ada kecerdasan absolut di hadapan kosmos, pencipta, Tuhan.