Pertanyaannya adalah, apakah hukum Musa ada sebelum atau sesudah para nabi seperti Amos, Hosea, Yesaya, dan Mikha? Sejumlah kecil sarjana telah menempatkan para nabi di hadapan Hukum. Di antaranya adalah Eduard Reuss (1833), JFL George (1835), William Vatke (1835); ini dihidupkan kembali oleh KH Graf pada tahun 1866. Di sini sebab dan akibat benar-benar terbalik dan posisi ini dianggap jelas tidak masuk akal. Namun ini memberikan Wellhausen petunjuk yang dia butuhkan untuk membuat seluruh sejarah Alkitab Israel/Yahudi benar-benar dapat dipahami dalam bukunya tentang Hexateuch dan dalam Prolegomena.Kedua jilid ini, karya-karyanya yang paling penting tentang sejarah Yahudi, segera membalikkan konsensus yang ada tentang masalah ini dan menyebabkan sebuah revolusi ilmiah. Wellhausen menerima apa yang disebut "hipotesis dokumenter" bahwa kelima kitab Musa tidak ditulis oleh Musa melainkan terdiri dari empat sumber berbeda, belakangan, dan anonim yang telah ditetapkan oleh para sarjana dengan huruf, J, E, D, dan Kesimpulan akhir P. Wellhausen adalah bahwa Yudaisme dan Pentateukh yang masih ada tidak ada sebelum abad ke-5 SM. Ia percaya bahwa imam Ezra, bukan Musa pada milenium kedua SM, yang melembagakan Yudaisme sekitar tahun 444 SM.
Â
Pada musim panas 1872, William Robertson Smith, konon sarjana Semit terbesar yang masih hidup di Inggris, bertemu Wellhausen saat bekerja dalam bahasa Arab dengan Paul Lagarde di Gottingen. Hubungan ini nantinya akan membuahkan hasil. Selama tahun 1881 hingga 1888, Smith menjadi co-editor Britannica edisi ke-9 dan mempekerjakan Wellhausen untuk menulis artikel panjang tentang Israel, Pentateuch, dan Septuaginta, serta beberapa entri kecil tentang Musa dan Moab. Encyclopaedia Britannica edisi ke-9 menganjurkan dan mendukung evolusi biologis dan studi kritis Alkitab, dua bidang yang sangat bertentangan dengan tradisi Yahudi-Kristen.
Â
Selama tahun-tahun ini ia juga menerbitkan, Die Kleinen Propheten Ubersetzt, Mit Noten (1892), sebuah terjemahan dari para nabi kecil dengan sebuah komentar kecil; Israelitische und Judische Geschiscte (1894), perluasan artikelnya tahun 1881 tentang Israel yang muncul dalam Encyclopaedia Britannica edisi ke-9 ; dan Kitab Mazmur, Edisi Kritis Teks Ibrani (1895).
Â
Pada tahun 1882, Wellhausen pindah ke Halle sebagai asisten profesor dalam bahasa Semit. Dia pindah ke Marburg tiga tahun kemudian, setelah menerima jabatan profesor penuh. Dia tinggal di Marburg (1885-91) merupakan tahun-tahun paling bahagia dalam hidupnya. Selama waktu ini dia menceritakan kepada rekan-rekan dekat dan teman-temannya bahwa dia "muak" dengan Perjanjian Lama.
Â
Pada tahun 1892 Wellhausen kembali ke Gottingen, di mana dia menulis dan mengajar selama sisa hidupnya. Dia mencurahkan sebagian besar waktunya untuk penjelasan lengkap tentang Islam awal. Sejumlah artikel, monografi, dan buku tentang masalah ini mengalir dari penanya. Wellhausen menghabiskan lebih dari 20 tahun merekonstruksi fase awal sejarah Islam. Beberapa karyanya yang paling penting tentang Arab dan Islam meliputi: Muhammed in Medina (1882), terjemahan dari Maghzai karya al-Waqidi , sebuah karya tentang ekspedisi militer Muhammad; Leider der Hudhailiten (1884), studi puisi Arab awal suku Hudhail; dan Resta Arabischen Heidentum (1887), sebuah studi tentang paganisme Arab pra-Islam dan kebiasaan agama Semit komparatif. Lainnya termasuk:Medina vor dem Islam (1889); Skizzen und Vorarbeiten (1889-1899), kumpulan monografi terpelajar, kebanyakan tentang Islam; dan Die Religiouspolitshe Oppositionsparteien Im Alten Islam (1901), terjemahan bahasa Inggris (1975), sebagai The Religiopolitical Factions in Early Islam. Das Arabische Reich und Sein Sturz (1902), terjemahan bahasa Inggris (1927), sebagai Kerajaan Arab dan Kejatuhannya, umumnya dianggap sebagai mahakarya Wellhausen tentang sejarah Arab-Islam awal.[6]
Â
Pada tahap terakhir karir Wellhausen, setelah sekitar tahun 1900, dia mengalihkan perhatiannya ke Perjanjian Baru. Karyanya di sini, meski sangat dihargai di beberapa kalangan, tidak sepenting tulisannya tentang Yudaisme dan Islam. Masih Wellhausen terbukti menjadi pendahulu dari "Kritik Bentuk" atau "Formgeschichte" Perjanjian Baru kemudian, seperti yang dikembangkan oleh Martin Dibelius, KL Schmidt, dan Rudolf Bultmann. Wellhausen menulis komentar tentang keempat Injil, Kisah Para Rasul, dan Wahyu. Dalam semua tulisan Perjanjian Barunya, Wellhausen menolak gagasan Johannes Weiss (1863-1914) dan Albert Schweitzer (1875-1965) yang menghubungkan ajaran Yesus dengan pemikiran apokaliptik dan eskatologis Yahudi kontemporer.