Sejalan dengan terpilihnya Bupati dan Wakil Bupati Toba Samosir periode 2005-2010, maka ditetapkan Visi Kabupaten Toba Samosir, ”Menjadi Kabupaten Terdepan, Makmur, Adil dan Sejahtera Di Sumatera Utara Tahun 2010 (TOBAMAS 2010)”.
Pada tahun 2006 Pemerintah Kabupaten Toba Samosir kembali melaksanakan pemekaran kecamatan yakni Kecamatan Tampahan dari Kecamatan Balige, Kecamatan Siantar Narumonda pemekaran dari Kecamatan Porsea dan Kecamatan Nassau pemekaran dari Kecamatan Habinsaran. Pemekaran ketiga kecamatan baru tersebut ditetapkan dengan Peraturan Daerah Kabupaten Toba Samosir Nomor 17 Tahun 2006 Tentang Pembentukan Kecamatan Siantar Narumonda, Kecamatan Nassau dan Kecamatan Tampahan.
Pada tahun 2008 juga dilaksanakan pemekaran kecamatan yaitu Kecamatan Parmaksian pemekaran dari Kecamatan Porsea dan Kecamatan Bonatua Lunasi pemekaran dari Kecamatan Lumbanjulu yang ditetapkan dengan Peraturan Daerah Nomor 5 Tahun 2008 Tentang Pembentukan Kecamatan Parmaksian dan Kecamatan Bonatua Lunasi. Pada tahun 2008 juga dilakukan pemekaran desa sebanyak 24 (dua puluh empat) desa.
Seiring perjalanan Pemerintah Kabupaten Toba Samosir sampai akhir tahun 2009 Pemerintah Kabupaten Toba Samosir menetapkan pembentukan 28 (dua puluh delapan) desa sehingga wilayah administrasi Pemerintahan Kabupaten Toba Samosir sampai saat ini terdiri dari 16 (enam belas) kecamatan yang terbagi dalam 13 (tiga belas) kelurahan dan 231 (dua ratus tiga puluh satu) desa.
Kemudian pada tanggal 15 Desember 2008 terjadi Pergantian Antar Waktu (PAW) DPRD untuk mengganti Ketua DPRD Kabupaten Toba Samosir dan terpilih Mangatas Silaen sebagai Ketua DPRD Kabupaten Toba Samosir menggantikan Tumpal Sitorus untuk sisa masa bakti 2004-2009.
Pada tanggal 9 April 2009 dilaksanakan Pemilu Legislatif dan untuk Kabupaten Toba Samosir terpilih 25 Anggota DPRD yang dilantik pada tanggal 15 Desember 2009 dan selanjutnya pada tanggal 3 Maret 2010 dengan Surat Keputusan Gubernur Sumatera Utara Nomor : 188.44/93/KPTS/2010 Tentang Peresmian Pengangkatan Pimpinan DPRD Kabupaten Toba Samosir Masa Jabatan 2009-2014 ditetapkan Sahat Panjaitan sebagai Ketua dan Jojor Tambunan, Rahmat Kurniawan, masing-masing sebagai Wakil Ketua.
Pada tanggal 12 Mei 2010 Kabupaten Toba Samosir melaksanakan Pemilihan Bupati dan Wakil Bupati untuk masa jabatan 2010-2015, dan pasangan Pandapotan Kasmin Simanjuntak dan Liberty Pasaribu, SH, M.Si berhasil meraih suara terbanyak. Pada tanggal 12 Agustus 2010, dengan Keputusan Menteri Dalam Negeri Nomor 131.12.278 Tahun 2010 Tentang Pengesahan Pemberhentian dan Pengesahan Pengangkatan Bupati Toba Samosir Provinsi Sumatera Utara oleh Gubernur Sumatera Utara Hai Syamsul Arifin, SE melantik pasangan Bupati dan Wakil Bupati Toba Samosir yaitu Pandapotan Kasmin Simanjuntak dan Liberty Pasaribu, SH, M.Si sebagai Wakil Bupati Toba Samosir periode 2010-2015. Sejalan dengan dilantiknya Bupati dan Wakil Bupati Toba Samosir Periode 2010-2015 dengan Peraturan Daerah Nomor 3 Tahun 2010 Tentang Rencana Pembangunan Jangka Menengah Daerah (RPJMD) Kabupaten Toba Samosir Tahun 2011-2015 ditetapkan Visi Kabupaten Toba Samosir, yaitu : ”Terwujudnya kabupaten Toba Samosir yang memiliki rasa kasih, peduli dan bermartabat.”
Berdasarkan Surat Keputusan Gubernur Sumatera Utara Nomor : 821.23/3410/2011 Tantang Pengangkatan Sekretaris Daerah Kabupaten Toba Samosir ditetapkan Drs. Liberty Manurung, MM, Biztel sebagai Sekretaris Daerah Kabupaten Toba Samosir, namun pada tanggal 3 Juli 2014 berdasarkan Surat Keputusan Gubernur Sumatera Utara Nomor : 821.23/1683/2014 tanggal 26 Juni 2014 tentang Pengangkatan Sekretaris Daerah Kabupaten Toba Samosir, maka Drs. Sudy Murphy o. Sitorus, SH, M.Si dilantik menjadi Sekretaris Daerah Kabupaten Toba Samosir menggantikan Drs. Liberty Manurung, MM, Biztel.
Pada tahun 2014 Kabupaten toba Samosir kembali melaksanakan Pemilihan Legislatif dan menetapkan 30 (tiga puluh) anggota DPRD Kabupaten Toba Samosir periode 2014-2019. Sesuai dengan peraturan yang berlaku bahwa Pimpinan DPRD ditetapkan dari partai dengan jumlah Anggota DPRD terbanyak maka terpilihlah Ir. Boike Pasaribu sebagai Ketua DPRD, Asmadi Lubis, SH, M.Kn dan Tonny Simanjuntak SE masing-masing sebagai Wakil Ketua.
Dalam rangka mengisi kekosongan jabatan Bupati Toba Samosir maka sejak tanggal 1 April 2015 Wakil Bupati toba Samosir Liberty Pasaribu, SH, M.Si ditetapkan sebagai Pelaksana Tugas Bupati Toba Samosir sampai habis periode masa jabatan 2010-2015 yaitu tanggal 12 Agustus 2015. Selanjutnya sesuai Surat Menteri Dalam Negeri Nomor : T.131.12/2388/OTDA Tanggal 10 Agustus 2015 dihunjuk Sekretaris Daerah Kabupaten Toba Samosir Drs. Audy Murphy O. Sitorus, SH, M.Si sebagai Pelaksana Tugas harian Bupati Toba Samosir dan kemudian berdasarkan Surat Keputusan Menteri Dalam Negeri Nomor : 131.12-5264 Tahun 2015 Hasiholan Silaen, SH yang menjabat Asisten Pemerintahan Sekretariat Daerah Provinsi Sumatera Utara dilantik sebagai Penjabat Bupati Toba Samosir oleh Gubernur Sumatera Utara atas nama Menteri Dalam Negeri di Kantor Gubernur Sumatera Utara.
Pada tanggal 9 Desember 2015, Kabupaten Toba Samosir dan beberapa kabupaten lainnya melaksanakan Pemilihan Kepala Daerah secara serentak diseluruh Indonesia dan melalui Surat Keputusan Komisi Pemilihan Umum Kabupaten Toba Samosir Nomor : 01/Kpts/002.434.434801/2016 Tentang Penetapan Pasangan Calon Bupati dan Wakil Bupati Toba Samosir Terpilih dalam Pemilihan Bupati dan Wakil Bupati Toba Samosir Tahun 2015 menetapkan perolehan suara terbanyak yaitu Ir. Darwin Siagian dan Ir. Hulman Sitorus, MM.
