a. System pengajaran
Pengajaran menggunakan system pengajaran sorokan, bandongan, hafalan dan musyawarah. Sekarang ini telah berubah menjadi system madrasah atau sekolah.
b. Pemberian ilmu pengetahuan
Ilmu pengetahuan umum sudah ada namun masih mempertahankan ilmu agama dan bahasa arabnya sebagai identitas kultur tersebut
c. Komponen pendidikan pesantren
Diberikaan keterampilan sesuai kemampuan dan kebutuhan santri dan masyarakat sekitar seperti kesenian yang mengandung islami.
Metode pembelajaran di pesantren
Terdapat dua aspek secara umum metode pembelajaran pondok pesantren yaitu
a. Metode yang bersifat tradisional atau salaf
Metode ini yaitu metode yang pembelajarannya yang diselenggarakan menurut kebiasaan yang telah lama dilaksanakan pada pesantren atau dapat juga disebut metode asli atau original pondok pesantren. Contohnya metode sorogan, badongan/wetonan, musyawarah/basaul masa'il, pengakajian pasaran, hafalan/muhafazah, demonstrasi/praktek ibadah, rihlailmiah, muhawarah/muhadassah dan riyadoh .
b. Metode pembelajaran yang bersifat modern atau tajdidi