Logo UIN KHAS Jember sekilas terlihat tebal dan kokoh serta memiliki desain yang tidak rumit dan sederhana sehingga membuat kesan bahwa logo ini akan mudah diingat. Selain itu dengan prinsip kesederhanaan serta simplifikasi yang dimiliki logo ini, maka akan mudah diaplikasikan dalam berbagai media seperti stempel, stiker mobil dinas, baground sampul dan lain sebagainya. Â Â
Salah satu dasar utama yang digunakan dalam desain logo ini yakni menggunakan kitab suci Alquran sebagai sumber dari segala hukum Islam yang harus dijaga dan dipelihara kemurnian ajarannya serta sebagai landasan iman, titik pusat yang menjiwai segala macam disiplin ilmu.
Kemudian juga terdapat bentuk sayap disisi kanan kiri yang melambangkan kekuatan dan kesanggupan serta dinamika kemauan yang kuat untuk terus maju dan berkembang, terbang ke atas. lambang sayap juga menyimpulkan pendirian merupakan dasar kekuatan yang kokoh.
Simbolis air terjun yang mencerminkan sumber utama untuk kebutuhan hidup setiap manusia. Sedangkan kebutuhan hidup yang ada  untuk manusia juga disebut dengan kata rejeki. Air yang jatuh dari ketinggian mempunyai arti bahwa rejeki diberikan oleh Allah SWT yang maha tinggi dan luhur kepada segenap manusia di bawah, di bumi.#tamam  Â
