Bank Mega Syariah KCP Cideng terus berupaya menerapkan sekaligus mengembangkan Sistem Pengendalian Internal pada semuaÂ
tingkatan fungsional sesuai struktur organisasi Bank Mega Syariah KCP Cideng yang dirancang untuk memberikan keyakinanÂ
tentang pencapaian empat tujuan berikut ini:
1. Meningkatkan kepatuhan dan disiplin terhadap ketentuan yang berlaku dalam mewujudkan pelaksanaan sistem perbankan  secaraÂ
sehat, efektif dan efisien.
2. Memastikan kewajaran dan keandalan akurasi Laporan Keuangan (Pos-pos Neraca & Rugi Laba, Rekening Administratif) sesuaiÂ
dengan system prosedur dan ketentuan yang berlaku.
3. Memastikan bahwa sistem pengendalian internal berkaitan dengan pelaksanaan operasional Bank terutama penerapanÂ
manajemen risiko, pelaksanaan Good Corporate Governance utamanya kepatuhan terhadap hukum dan peraturan yang berlakuÂ
sehingga dalam pencapaian sasaran yang telah ditetapkan oleh manajemen, telah cukup,efektif dan aman.
4. Memastikan bahwa seluruh kegiatan operasional Bank tidak terjadi Fraud dan memastikan berjalannya sistem whistleblowing