1. Fase Fondasi : PAUD
2. Fase A : Kelas I-II SD/MI
3. Fase B : Kelas III-IV SD/MI
4. Fase C : Kelas V-VI SD/MI
5. FAse D : Kelas VII-IX SMP/MTs
6. Fase E : Kelas X SMA/SMK/MA/MAK
7. Fase F :
a. Kelas XI-XII SMA/MA/MAK
b. Kelas XI-XII SMK Program 3 tahun
c. Kelas XI-XII SMK program 4 tahun
Di SMK Wonogiri telah melaksanakan  kegiatan P5 dengan  2 tema yaitu jejak karbon dan perubahan iklim serta untuk tema yang kedua adalah kearifan local. Dalam projek P5 tema kedua tentang kearifan lokal ini siswa siswi diharapkan mampu memanfaatkan bahan makanan yang ada disekitar lingkungan dan dapat diolah menjadi makanan yang dikreasi menjadi makanan kekinian yang awalnya bahan makanan tersebut tidak disukai , dengan adanya kreasi bisa merubah selera warga utamanya siswa menjadi tertarik dan menikmati makanan yang dibuat. Selain itu siswa juga memainkan permainan anak anak dijaman dulu, seperti gobag sodor, egrang, dan lain lain.
