Nama yang  berasal dari nama seorang raja, yaitu Nai Kopan atau Lai Kopan, yang memerintah Kota Kupang sebelum bangsa kemudian disebut oleh Belanda sebagai Koepan dan dalam bahasa sehari-hari menjadi Kupang.
AMAN
Kota ini pada awalnya dikenal sebagai kota yang sangat aman walaupun banyak suku yang tinggal di kota Kupang.
SEHAT
Kota yang terletak di pinggiran pantai yang memiliki udara segar yang sehat. Banyak yang merebut tinggal di tempat ini.
INDAH
Terletak di Teluk Kupang merupakan suatu keindahan tersendiri bagi Kota Kupang. Pasir putih dan pepohonan menghiasi bingkai pantai kota ini. Tak kalah penting, kota ini memiliki senja yang sangat indah.
HARMONIS
Harmoni (dalam bahasa Yunani: harmonia, berarti terikat secara serasi/sesuai). Dalam ilmu filsafat, harmoni adalah kerja sama antara berbagai faktor dengan sedemikian rupa hingga faktor-faktor tersebut dapat menghasilkan suatu kesatuan yang luhur.
Dalam prinsip/hukum alam semesta Kota Kupang, kota ini tertib dalam suatu kesatuan walaupun hidup dalam perbedaan atau keberagaman.
Kota Kasih ini terus digaungkan dan dibanggakan dan terkenal di dunia nasional dengan Mars Kupang Kota Kasih yang diciptakan oleh ketika Joni Teendens.