Kereta dari Stasiun Bogor hanya melayani relasi ke Stasiun Cikini hingga ke Stasiun Jakarta Kota.
Penumpang yang dari Stasiun Jatinegara, atau dari Stasiun Duri, Stasiun Tanah Abang jika akan ke Stasiun Tebet dan ke stasiun-stasiun selanjutnya hingga ke stasiun akhir, Bogor, harus transit di Stasiun Manggarai.
Dari Stasiun Manggarai baru naik kereta tujuan Stasiun Bogor di jalur 12 dan jalur 13 di peron atas.
Diketahui peron 12 dan 13 menuju ke arah Bogor/Depok/Nambo. Sejumlah petugas terlihat sedang mengarahkan penumpang menuju peron sesuai tujuan masing-masing.
Sementara itu, kereta dari Stasiun Bekasi ke Stasiun Jakarta Kota tidak ada lagi. Penumpang yang akan ke Stasiun Cikini dan ke stasiun-stasiun berikutnya hingga stasiun akhir Jakarta Kota, harus transit di Stasiun Manggarai.
Nah dari Stasiun Manggarai baru deh naik kereta yang ke tujuan Jakarta Kota di jalur 10 dan jalur 11 di peron atas.
Begitu pula ketika akan ke arah Stasiun Bekasi. Penumpang harus transit di Stasiun Manggarai lalu lanjut naik kereta di jalur 7.
Jalur 1 yang biasanya sering dipakai untuk relasi Bekasi - Jakarta Kota tidak lagi digunakan. Jalur 1 hanya diperuntukkan bagi perlintasan kereta tujuan Jawa atau jarak jauh.
Biasanya jika naik kereta tujuan Bekasi naik di jalur 4, mulai hari ini jalur ini juga tidak digunakan. Hanya untuk perlintasan kereta jarak jauh.
Berkali-kali petugas menginformasikan kepada penumpang mengenai perubahan rute ini.