 Pada tahu 1965 tepatnya pada malam tanggal 30 september, telah terjadi usaha pemberontakan kepada negara republik Indonesia yang dilakukan oleh salah satu partai politik saat itu, yaitu Partai Komunis Indonesia (PKI),yang mana pada malam itu, mereka memulai pemberontakan itu dengan menculik beberapa jenderal yang mereka anggap berpengaruh dalam pemerintahan saat itu.
Setelah menculik para jenderal, mereka pun melakukan penyiksaan dan pembantaian terhadap jenderal-jenderal tersebut yang pada akhirnya,mereka membuang jasad para jenderal tersebut di sebuah sumur yang tidak terpakai yang sekarang disebut dengan "lubang buaya".
Lubang buaya itu sendiri hanya memiliki diameter 75 Cm dan kedalaman 12 meter, didalam  lubang itulah mereka membuang jasad dari para jenderal itu dengan tanpa hormat dan kemudian ditimbun sehingga proses pencarian jasad jenderal itu berjalan cukup lama dan sulit.
Di dalam penculikan itu, mereka mengikut sertakan Cakra birawa (pasukan pengawal presiden) yang termakan dengan tipu muslihat PKI saat itu, yaitu mereka membuat isu bahwa jenderal-jenderal tersebut akan membentuk suatu gerakan yang dinamakan dengan dewan jenderal, yang mana dalam isu yang dibuat oleh PKI itu.
Dewan Jenderal ini hendak melengserkan pemerintahan Ir. Soekarno, yang saat itu Ir.Soekarno sedang mengalami sakit, padahal yang sebenarnya adalah, mereka yang hendak melengserkan pemerintahan Ir.Soekarno, dengan membantai para jenderal yang mereka anggap menjadi penghalang bagi jalan mereka ini, kemudian pada akhirnya.
Setelah mereka berhasil melengserkan Ir.Soekarno, mereka akan mengganti ideologi Negara kita ini dengan ideologi Komunisme yang tidak percaya dengan adanya tuhan.
Ya, dan itulah yang dilakukan oleh PKI, mereka rela melakukan apa saja demi tercapainya apa yang mereka inginkan, mereka selalu berusaha untuk menyebarkan dan membuat orang-orang disekitarnya memiliki paham komunis walaupun itu berarti harus menggunakan kekerasan, bahkan membunuh orang tersebut.Â
Adapun  pemberontakkan yang dilakukan PKI ini bukan pertama kalinya, mereka sudah sering melakukan pemberontakkan yang menyebabkan banyak nyawa yang melayang, terutama nyawa para kiyai dan santri, demi mengganti ideologi negara ini menjadi ideologi komunisme.Â
PKI sudah masuk ke Indonesia sejak tahun 1926,pada tahun itu, mereka ikut dan bergabung dalam suatu organisasi yaitu Sarekat Islam, dan ikut membaur di dalamnya, dan lagi-lagi, mereka menyebarkan paham komunis itu di dalam tubuh Sarekat Islam.
Sehingga Sarekat Islam inipun terpecah menjadi 2 golongan yang pertama pro islam dan yang kedua pro komunis, dan pada akhirnya organisasi ini pun bubar, kemudian golongan yang pro dengan Komunis, Â mereka pun membuat sebuah organisasi baru yaitu ISDV.
Pada tahun 1926, PKI yang waktu itu masih berbentuk ISDV ini, juga ikut andil dalam berusaha memerdekakan negara ini dari penjajahan Belanda, karena salah satu prinsip mereka adalah kebebasan dan mereka tidak mau di jajah, sehingga pada tahun itu, mereka memberontak kepada penjajah, namun keberuntungan tidak memihak kepada mereka sehingga mereka mengalami kekalahan, dan mereka pun dikejar oleh pasukan Belanda.
