Beliau juga mengajarkan bahwa keberagaman yang ada di Indonesia harus dihormati dan dijaga, karena keberagaman itu adalah kekayaan bangsa. Dalam konteks ini, beliau berinisiatif untuk mengadakan pertemuan antarumat beragama dan dialog antarumat beragama, untuk menumbuhkan sikap saling menghormati dan toleransi antarumat beragama.
Pemikiran KH. Achmad Shidik juga sangat peduli dengan masalah sosial masyarakat. Beliau memandang bahwa agama harus dipahami dengan lebih mendalam dan diterapkan untuk menyelamatkan masyarakat dari masalah kemiskinan, ketertinggalan, dan ketidakadilan.
Selain itu, KH. Achmad Shidik juga mengajarkan tentang pentingnya pengembangan ekonomi umat, dengan mengajak masyarakat untuk berdagang dengan cara yang bermanfaat dan sesuai dengan aturan Islam. Beliau juga mempraktikkan pemikiran-pemikiran keagamaan dalam pengembangan bisnisnya, yaitu dalam bentuk usaha tani dan pemuliaan jati diri para santri.
Secara keseluruhan, pemikiran KH. Achmad Shidik adalah tentang pentingnya pemahaman sejati tentang agama Islam, di mana keikhlasan, ketoleran, keseimbangan antara agama dan kemasyarakatan, dan kedamaian dunia menjadi hal yang sangat penting. Beliau berbicara tentang harmonisasi dan kesetaraan antarumat beragama, serta kemampuan untuk menyelamatkan masyarakat dari masalah sosial dan kemiskinan dengan mengedepankan prinsip yang benar dan tepat dalam memahami keagamaan. Pemikiran beliau memberikan inspirasi dan motivasi dalam mengaplikasikan nilai-nilai agama dalam kehidupan sosial dan bisnis.