Namun dalam penelitian ketiga ini, Nitimiharjo tidak saja melakukan ekskavasi di beberapa tempat yang diduga memiliki banyak produk-produk budaya kuno di kawasan ini. Beberapa kawasan yang dikunjungi antara lain Situs Kalitajem, ditemukan beberapa calon beliung, tatal dan pecahan tembikar.
Selanjutnya penelitian yang lebih komperhensif penelitian ke empat dilakukan pada tangal 22 Oktober -- 1 November 2008 oleh Badan Arkeologi Yogyakarta yang dipimpin oleh Sofyan Noerwidi. \
Dalam penelitian ini misteri hunian sejarah dan neolitik sedikit menemukan titik terang, bahwa di lapisan budaya neolitik merefleksikan sisa perkampungan dan perbengkelan. Sedangkan dilapisan budaya sejarah merepresentasikan sisa perkampungan dari masa kerajaan Majapahit abad XIII dan XV M.
Dalam penelitian ini baru dapat di lakukan pertanggalan absolut situs Kendenglembu dengan menggunakan metode anlisis Accelerator Mass Spectrometry yang dilakukan di Laboratorium The University of Arizona, Amerika Serikat.Â
Berdasarkan analisa AMS ini ditemukan bahwa terdapat kontradiksi yang menjadikan situs neolitik Kendeng Lembu masih sebuah misteri yang perlu diperlukan penelitian lebih lanjut.
Dalam analisa AMS diperoleh produk produk budaya di situs neolitik Kendenglembu diperoleh data arkeologi sebagai berikut :
Tabel hasil Analisis Pertanggalan
AA#
Sample ID
Materian
d13C