Dalam kasus oksidasi, LDL dapat ditangkap oleh proteoglikan, mencegah penghabisannya oleh penghabisan kolesterol HDL. Sebuah HDL  berfungsi normal dapat mencegah  oksidasi LDL dan proses inflamasi berikutnya diamati setelah oksidasi. Dalam kondisi fisiologis abnormal tertentu, seperti infeksi sistemik atau sepsis, komponen kunci HDL diubah. (HDLC), fosfolipid, apoAI (lipoprotein utama  HDL yang ditemukan memiliki sifat anti-inflamasi yang bermanfaat) dan peningkatan kadar amiloid A serum.
 Perubahan komposisi HDL ini biasanya disebut sebagai  fase akut dari fase akut HDL. Selama fase inflamasi, HDL mungkin kehilangan kemampuannya untuk menghambat oksidasi LDL. Memang, komposisi HDL yang berubah ini dikaitkan dengan peningkatan mortalitas pada pasien sepsis dan hasil klinis yang lebih buruk.
