Sementara kebebasan berfikir merupakan anjuran Cak Nur berikutnya, dengan adanya kebebasan berfikir dan dilandasi dengan keeimanan yang mantap akan memunculkan ide-ide yang baru untuk merespon atau memberi solusi atas persoalan yang tengah dihadapi. Menurut Cak Nur, betapa pun aneh (ide/gagasan) kedengarannya di telinga, haruslah mendapat jalan untuk dinyatakan. Tidak jarang, dari ide-ide dan pikiran yang semula dianggap salah dan palsu itu, ternyata kemudian benar.
Adapun soal sikap terbuka dengan jelas Cak Nur menyandarkan gagasan ini kepada ungkapan ulama "Seyogyanya kita tidak merasa malu menerima dan menjaga suatu kebenaran dari manapun ia berasal, meski dari bangsa-bangsa yang jauh dan berbeda dari kita".Â
Cak Nur menilai, "Sikap terbuka merupakan salah satu tanda bahwa manusia memperoleh petunjuk dari Allah, sedangkan sikap tertutup sehingga berdada sempit dan sesak bagaikan orang yang beranjak ke langit, merupakan salah satu tanda kesesatan".Â
Modernisasi dalam sorotan Cak Nur
Cak Nur sapaan akrabnya, memandang modernisasi sebagai suatu gagasan yang memiliki tarikan nafas yang sama dalam ajaran Islam. Namun sebelum itu, ada baiknya terlebih dahulu menegaskan bahwa, menurut Cak Nur, modernisasi sangat identik dengan rasionalisasi.Â
Rasionalisasi berarti proses perombakan pola berfikir dan cara kerja yang lama yang tidak akliah (arasional) menjadi akliah (rasional). Dalam hal ini kaitannya adalah ilmu pengetahuan, ilmu pengetahuan tidak lain merupakan hasil penemuan manusia atar hukum-hukum alam yang material. Singkatnya, modernisasi adalah upaya memaksimalkan rasional.
Bagi umat Islam, modernisasi bukan lagi menjadi hal yang baru, misalnya dalam Al-Quran tercatat sebagai berikut:Â
        "Allah menciptakan seluruh alam raya untuk kepentingan manusia, kesejahteraan hidup dan kebahagiaannya, sebagai rahmat dari-Nya. Akan tetapi, hanya segolongan manusia yang berfikir atau berasional yang akan mengerti dan kemudian memanfaatkan karunia itu" (QS. 45:13).
        "Karena adanya perintah untuk mempergunakan akal-pikiran (rasio) itu, maka Allah melarang segala sesuatu yang menghambat perkembangan pemikiran, yaitu terutama berupa warisan membuta terhadap tradisi-tradisi lama, yang merupakan cara berfikir dan tata kerja generasi sebelumnya" (QS. 2:170).
Lebih lanjut Cak Nur menjelaskan, modernisasi berarti berfikir dan bekerja menurut fitrah dan sunatullah yang haq. Sunnatullah telah mengejawantahkan dirinya dalam hukum alam, sehingga untuk menjadi modern, manusia harus mengerti terlebih dahulu hukum yang berlaku dalam alam. Pemahaman manusia terhadap hukum alam, melahirkan ilmu pengetahuan, sehingga modern berarti ilmiah. Dan ilmu pengetahuan diperoleh manusia melalui akal rasionya, sehingga modern berarti ilmiah, berarti pula rasional.
Meski modernisasi adalah upaya untuk memaksimalkan fungsi rasio agar menemukan ilmu pengetahuan-pengetahuan terbaru untuk kehidupan manusia, Cak Nur telah memperingati satu hal yakni, ke-relevansian atas peran modernisasi tersebut terhadap realitas zaman yang ada. Cak Nur memandang, bisa jadi sesuatu yang dianggap modern, dapat dipastikan menjadi kolot alias tidak modern lagi di masa yang akan datang.
