Pemeliharaan semaian tanaman melon meliputi pembukaan dan penutupan sungkup, penyiraman, sortasi, serta pemupukan.
1. Pembukaan dan Penutupan Sungkup
Begitu dipindahkan ke polibag atau seedling tray, calon bibit harus ditutup dengan sungkup. Agar temperaturnya stabil, sungkup tersebut boleh ditutup waring, mulsa, atau karung goni. Usahakan sungkup tidak dibuka sampai munculnya tunas pertama.
Dalam waktu 2--3 hari, tunas pertama akan mucul. Dalam kondisi seperti ini, sungkup boleh dibuka selama 1--2 jam yang dimulai saat matahari terbit. Pembukaan sungkup ini dimaksudkan agar bibit lebih cepat tumbuh sekaligus sebagai adaptasi dengan sinar matahari.
Perlu diingat bahwa bibit melon ini masih rentan terhadap perubahan cuaca serta hama dan penyakit. Oleh karena itu, sungkup harus ditutup kembali saat hujan, matahari bersinar terlalu terik, dan pada malam hari.
Semakin hari, lamanya pembukaan sungkup dapat dilakukan semakin lama. Meskipun demikian, calon bibit ini tetap tidak boleh terkena air hujan. Kira-kira lima hari menjelang transplantasi, sungkup dapat dibuka selama sehari penuh. Hal ini dimaksudkan sebagai adaptasi dengan kondisi setelah ditanam di bedengan.
Penutupan sungkup ini harus benar-benar rapat, supaya kelembapan udara tetap terjaga serta semaian terhindar dari  paparan air hujan, hama, dan penyakit. Selain itu, suhu udara di dalam sungkup juga tetap terjaga.
2. Penyiraman
Pada awal persemaian, bibit hanya perlu disiram satu kali sehari, yaitu pada pagi hari. Penyiraman dilakukan menggunakan botol sprayer atau alat lain yang dapat mengeluarkan air dengan debit rendah. Hal ini dimaksudkan agar tidak banyak air yang terbuang dan polibag tidak rusak akibat terkena air.
Saat sungkup dibuka dan semaian terkena panas sinar matahari, terjadi penguapan, baik dari bibit maupun media tanam. Oleh karena iru, intensitas dan kuantitas penyemprotan dapat ditambah seiring bertambahnya waktu pembukaan sungkup.
Beberapa hari menjelang transplantasi, dapat dilakukan penyiraman dua kali sehari, yaitu pagi dan sore hari. Penyiraman pada siang hari tidak disarankan karena selain mubazir, juga dapat berakibat buruk terhadap pertumbuhan bibit.
