Eco-enzyme dapat membantu untuk menghilangkan pestisida, herbisida, cairan kimia dan parasit pada sayuran dan buah-buahan. Dengan melarutkan 2 sendok makan cairan Eco-enzyme dengan 1 liter air, kemudian rendam sayuran dan buah-buahan selama 45 menit. Cara ini juga dapat membuat rasa sayuran dan buah menjadi lebih gurih dan harum.
2. Pembersih rumah tangga
Larutkan 5ml eco-enzyme dengan 1 liter air, kemudian digunakan untuk mengepel lantai atau membersihkan perabotan rumah tangga. Lantai yang dipel dengan menggunakan cairan eco-enzyme akan lebih kesat dan lebih bersih.
3. Melancarkan pembuangan air septitank
Saluran pembuangan air septitank seringkali tersumbat karena kotoran dan minyak. Eco-enzyme dapat membantu memperlancar penguraian kotoran sehingga saluran pembuangan air septitank menjadi lancar. Larutkan 5ml eco-enzyme dengan 1 liter air dan siram kesaluran yang tersumbat.
4. Pupuk Menyuburkan tanaman
Ampas eco-enzyme dapat dijadikan pupuk organik pada tanaman. Caranya cukup blender ampas eco-enzyme hingga halus kemudian campurkan kedalam tanah. Cara ini juga dapat untuk menyuburkan tanah yang tandus.
5. Menyiram tanaman
Larutkan 20ml eco-enzyme dengan 1 liter air dan siramkan ke tanaman secara rutin maka tanaman akan cepat berbunga dan berbuah.
6. Sebagai pengusir hama alami
Campurkan 15ml eco-enzyme  ke dalam 500ml air kemudian semprotkan ketanaman. Ini dapat membantu mengurangi hama dan mengurangi penggunaan pestisida kimiawi.
