Setidaknya ada tiga praktek Ibadah Haji yang menurut Ali Syari'ati mempunyai kaitan erat dengan Sains dan Ilmu Pengetahuan. Ketiga praktek Haji itu adalah Wukuf di Arafah, Masy'aril atau Muzdhalifah dan Mina.
Menurut Ali Syariat, Wukuf di Arafah adalah gerakan pertama Haji. Dimulai pada tengah hari 9 Dzulhijjah. Orang berdiam diri di Arafah ketika matahari sedang memancarkan sinarnya yang terik.
Arafah secara bahasa dan sejarah berkaitan erat dengan Ilmu Pengetahuan. Arafah adalah tempat Adam dan Hawa bertemu pertama kali nya setelah diturunkah Allah dari surga. Dalam pertemuan pertama di Arafah lah Adam dan Hawa mengidentifikasi dirinya masing-masing sambil berupaya saling memahami diantara mereka berdua. Kedua upaya itu tidak akan lahir bila tidak memakai Ilmu Pengetahuan. Karena begitulah hakekat nya Ilmu Pengetahuan. Sebuah cara untuk memahami diri sendiri juga sekitar. Bukit Arafah adalah bukit Ilmu Pengetahuan.
Arafah yang berarti Jamak, mengartikan bahwa Ilmu Pengetahuan sebagai upaya untuk memahami realitas yang tinggal namun dengan beragam perspektif. Arafah dilaksanakan di siang hari, karena begitulah hakekat Ilmu Pengetahuan. Hubungan objektif yang sifatnya terang benderang.
Setelah melaksanakan Wukuf di Arafah, hal selanjutnya yang mesti dilakukan adalah Masy'aril Haram atau Muzdhalifah. Bila wukuf di Arafah dilaksanakan di siang hari, maka Masy'aril Haram dilaksanakan pada malam hari.
Masy'aril Haram adalah fase kesadaran. Fase lanjutan dari kehidupan berilmu pengetahuan. Dilaksanakan pada malam hari karena kesadaran akan lebih mudah diperoleh ketika kita berkontemplasi dalam kegelapan di keheningan malam. Masy'aril Haram adalah upaya subjektif manusia dengan berbagai pengetahuan yang dia peroleh.
Hubungan antara Arafah di siang hari dan Masy'aril Haram di malam hari adalah seperti manusia yang pada siang hari menelaah data dan fakta kemudian di malam hari berkontemplasi memaknai data dan fakta. Kesadaran akan tumbuh setelah orang mempunyai pengetahuan.Â
Setelah tuntas melaksanakan Masy'aril Haram, orang lalu bergerak ke Mina. Mina adalah simbol cinta yang merupakan tahapan ideal kehidupan. Mina adalah tempat manusia bertemu Allah dan Setan dimana di Mina inilah manusia mesti menentukan sikap dirinya. Apakah dia mau mengikuti Jalan Allah atau Jalan Setan.
Mina adalah momen terjadinya pertempuran dalam kehidupan manusia. Simbol nya ada pada peristiwa lempar Jumrah. Peristiwa ketika orang membawa kerikil dan melakukan tiga kali lemparan batu sebagai tanda sedang melempar setan. Ketiganya adalah Jumrah Al-Ula, Al-Wustho dan Al-Uqba/Aqabah.
Jumrah Al-Ula adalah upaya manusia melempar berhala ketamakan yang kerap bersemayam dalam dirinya. Simbol dari ketamakan dalam kehidupan manusia adalah Firaun. Orang yang tidak pernah berhenti menahan hasrat dirinya. Jumrah Al-Ula adalah lawan terhadap Arafah. Karena orang yang kerap terkena penyakit tamak adalah orang yang berilmu pengetahuan (Arafah)
Jumrah Al-Wusto adalah upaya manusia melempar berhala pada diri sendiri yang bernama egoisme atau mementingkan diri sendiri. Simbol egoisme dari kehidupan manusia adalah Qarun. Orang yang terus menerus mementingkan dirinya sendiri dan hancur karena mementingkan dirinya sendiri. Jumrah Al-Wustho adalah lawan terhadap Masy'ar. Karena sisi negatif dari orang yang sudah sadar adalah egoisme.
