Padahal di balik laku hariannya itu, Lara seorang keturunan Keluarga Croft yang kaya raya. Ayahnya, Richard Croft (Dominic West), adalah pemilik perusahaan induk dengan banyak lini usaha.
Lara sebenarnya berhak atas "warisan" peninggalan ayahnya itu. Tapi ia menolak menandatangani dokumen alih harta warisan.
Lara enggan menganggap ayahnya telah meninggal. Ia lebih suka menilai ayahnya belum pulang dari sebuah petualangan panjang selama tujuh tahun. Petualangan yang kemudian ia ketahui sebagai perjalanan mencari makam kuno Himiko.
Ya, dari buku harian ayahnya, diketahui bahwa Richard bukan semata menjalani bisnis di perusahaannya. Tetapi juga memenuhi ambisi mencari kekuatan supernatural untuk mengobati rasa kehilangan atas kematian istrinya.
Bermodal buku harian itu, Lara menapaki kembali jejak ayahnya, semata mencari kebenaran ihwal kabar kematian sosok yang ia cintai, yang senantiasa disampaikan orang kepercayaan ayahnya, Ana Miller (Kristin Scott Thomas).
Jadilah ia pergi ke Hongkong mencari kapal bernama Endurance yang kini dimiliki Lu Ren (Daniel Wu). Foto kapal itu termuat dalam dokumen milik ayahnya yang mengaku berhasil mendapatkan moda transportasi menuju makam kuno milik Himiko.
Anehnya, meskipun ayahnya telah hilang, kapal itu rupanya masih ada. Lara dan Lu Ren akhirnya berlayar menuju Pulau Yamatai di tengah Laut Iblis. Pulau itu dikenal misterius karena keberadaannya yang tidak terdeteksi radar.
Adegan perahu yang terguncang ombak hingga penampakan dari kejauhan fisik pulau dengan gundukan bukit dan gunung sangat mirip dengan tayangan dalam video game.
Kemiripan yang juga terjadi hingga sepasukan orang tak dikenal melumpuhkan Lara setelah berhasil mendarat di Pulau Yamatai.
Di sana pula Lara menunjukkan keahliannya bertahan hidup demi mendapati keberadaan sang ayah tercinta. Ia harus berhadapan dengan hutan lebat sekaligus mengeksplorasi keliarannya.
Ia juga bertemu dengan aneka tantangan bahkan jebakan, terlebih setelah pintu makam terbuka.
