Kritik dan Paradoks Pada Agama

Mitos palsu lainnya mencakup pernyataan  Paus melarang pembedahan manusia atau  beberapa ilmuwan dibakar karena gagasan ilmiah mereka. Tinjauan sejarah terbaru Sanjib Kumar Ghosh mengenai pembedahan mayat manusia menunjukkan  pada akhir Abad Pertengahan, pembedahan tidak dilakukan, meskipun alasannya tidak diketahui dengan pasti. Salah satu alasannya mungkin karena praktik seperti itu tidak diterima dalam etika Kristen. Sejak abad ke-12 Gereja Kristen mulai mengizinkan pembedahan, meskipun dekrit tertentu dikeluarkan untuk mengatur praktik tertentu.

Yang paling mengkhawatirkan adalah para ulama tidak berpartisipasi dalam praktik semacam itu. Kaisar Romawi Frederick II (1194-1250) mendorong kemajuan ilmu pengetahuan dengan dekrit yang memerintahkan  setidaknya satu mayat harus dibedah setiap lima tahun untuk studi anatomi, dengan kehadiran wajib bagi mereka yang berpraktik kedokteran atau bedah.

Sejak saat itu, pembedahan manusia pertama kali dilakukan di universitas-universitas Italia (awalnya Bologna, dan kemudian Padua, Florence, dan lain-lain), kemudian di Prancis, kemudian di Inggris Raya, dan kemudian menyebar ke seluruh dunia. tentangan dari Gereja Kristen. Namun, meski didiskreditkan, semua cerita ini masih diterbitkan secara berkala sebagai contoh sikap keras kepala para ulama dalam menghadapi kemajuan ilmu pengetahuan.

Astronom dan filsuf Giordano Bruno tercatat dalam sejarah di buku teks sebagai martir sains di tangan Inkuisisi pada abad ke-17. Mitos ini masih ada di sekitar sepertiga buku astronomi berbahasa Inggris. Sekali lagi, penelitian terbaru menunjukkan  penafsiran seperti itu perlu memenuhi syarat. Filsuf sains Amerika Thomas Kuhn menyatakan:

Bruno, sang filsuf dan mistikus   dieksekusi bukan karena Copernicalisme tetapi karena serangkaian ajaran sesat yang berpusat pada pandangannya tentang Tritunggal, ajaran sesat yang sebelumnya telah dieksekusi oleh umat Katolik lainnya. Ia, sebagaimana sering disebut, bukanlah seorang martir bagi ilmu pengetahuan.  

Dalam karya ulasan tertulis yang luar biasa, Luar Biasa. 7 Mitos Tentang Sejarah dan Masa Depan Sains dan Agama , Michael Newton Keas menyatakan  "gambaran  Bruno adalah seorang ilmuwan martir adalah mitos."  

Mungkin kasus yang paling terkenal adalah Galileo. Memang benar  Galileo diadili karena mengklaim  Bumi berputar mengelilingi Matahari, dan bukan sekadar hipotesis, seperti yang dituntut oleh Gereja Katolik. Namun uji coba tersebut memiliki lebih banyak elemen daripada gagasan sederhana  Galileo menentang gagasan  Bumi adalah pusat alam semesta. Para sejarawan telah menemukan  proses tersebut sangat bermuatan konservatisme ilmiah dan keegoisan kepausan.  Bertentangan dengan gagasan  agama Kristen merupakan hambatan bagi perkembangan ilmu pengetahuan, para sejarawan kini menyoroti semua dukungan yang telah diberikan Gereja terhadap penelitian ilmiah selama berabad-abad.  

Menurut Hannam, dukungan itu ada beberapa bentuknya. Salah satunya adalah masalah finansial. Hingga Revolusi Perancis, Gereja Katolik adalah sponsor utama penelitian ilmiah. Misalnya, mulai Abad Pertengahan, Gereja membayar para imam, biarawan, dan biarawan untuk belajar di universitas. Gereja bahkan menegaskan  sains dan matematika harus menjadi bagian wajib dari kurikulum. Hasilnya, pada abad ke-17 Ordo Jesuit menjadi organisasi ilmiah terkemuka di Eropa. 

Dia menerbitkan banyak artikel dan menyebarkan penemuan baru ke seluruh dunia, dengan penekanan khusus pada wilayah baru Amerika Latin. Di Eropa, beberapa katedral (misalnya Bologna, Paris, Florence) dirancang untuk  berfungsi sebagai observatorium astronomi dan memungkinkan penentuan kalender yang semakin tepat. Dan jangan lupa  genetika modern didirikan oleh Gregory Mendel, seorang kepala biara yang menanam kacang polong di taman biara di tempat yang sekarang disebut Republik Ceko.

Mitos lain yang tersebar luas adalah  Abad Pertengahan adalah periode stagnasi ilmu pengetahuan yang panjang dan sedikit kemajuan dalam ilmu pengetahuan. Kita sekarang tahu  Abad Pertengahan (khususnya Abad Pertengahan Awal) adalah masa inovasi dan kemajuan, dengan penemuan-penemuan seperti jam mekanik, kacamata baca, percetakan, dan penemuan-penemuan seperti percepatan gerak, perputaran bumi, dan inersia, kemudian dimasukkan dalam karya Copernicus dan Galileo. 

Bahkan ada kemajuan ilmiah yang signifikan di era "paling gelap" Abad Pertengahan Awal (500 SM hingga 1000 SM) setelah depresi yang terjadi setelah jatuhnya Roma. Produktivitas pertanian meroket berkat penggunaan tali kekang kuda dan bajak berat yang memungkinkan pekerjaan di tanah liat keras di Eropa Tengah dan Utara, rotasi tanaman, dan penemuan kincir air, serta kemajuan-kemajuan lain yang menyebabkan peningkatan pesat populasi di Eropa.