Hal ini tidak menghalangi munculnya diskusi menarik di akhir periode abad pertengahan mengenai persoalan kedaulatan yang berorientasi, seolah-olah itu belum cukup, pada rakyat dan posisi mereka dalam diskusi tersebut. Tokoh protagonis terbesar saat itu adalah Santo Thomas Aquinas dan Marsilio de Padua.
Mari kita mulai dengan mengingat konsep kedaulatan memiliki arti tertinggi, tidak dapat diajukan banding, dan tidak tunduk pada kekuatan lain selain dirinya sendiri. Ini adalah supremasi yang tidak dapat diajukan banding dan bersifat mengikat karena bersifat substantif, orisinal, dan final. Kemerdekaan dari kekuatan asing merupakan ciri khas dari konsep kedaulatan; serta kemampuan mengatur diri sendiri dan memberikan aturan atau hukum pada diri sendiri.
Oleh karena itu, pertanyaan-pertanyaannya adalah sebagai berikut: Di manakah letak kedaulatan; Di manakah kekuasaan untuk mengarahkan dan membuat undang-undang berada; Apa sumber kekuasaan tertinggi yang harus dipatuhi oleh setiap warga negara; Dari mana asal legitimasi suatu yurisdiksi; Di manakah letak supremasi yang tidak dapat ditarik kembali yang mengikat semua orang;
Pertanyaan-pertanyaan tersebut, seperti yang mudah dilihat, berhubungan langsung dengan pertanyaan tentang kebebasan. Jawabannya akan membuat wilayah kebebasan individu tidak terlindungi atau, sebaliknya, akan memberikan jaminan yang menguntungkannya. Faktanya, posisi-posisi yang muncul pada abad ketiga belas dan keempat belas saling berjauhan justru karena posisinya mengenai kebebasan. Kita akan melihatnya di paragraf berikutnya.
Santo Thomas Aquinas mungkin adalah pemikir abad pertengahan yang paling abad pertengahan. Saya berpendapat ia tidak dapat menghindari menempatkan institusi gerejawi yang berpengaruh di dasar dan puncak karya monumentalnya. Sebuah institusi yang seiring berjalannya waktu tidak hanya meniru pemerintahan dunia secara organisasional tetapi menyerbu arena politik untuk bersaing dengan pemerintah dunia demi keunggulan dan hierarki.
Bagi Santo Thomas, Gereja Katolik Roma adalah segalanya. Dia harus membimbing segalanya dan mendominasi segalanya. Pada akhirnya, dalam visi Thomistik tentang alam semesta, yang spiritual lebih unggul sebagaimana yang abadi berada di atas yang temporal dan yang ilahi berada di atas manusia.
Dalam tatanan gagasan ini, Santo Thomas dengan jelas dan terbuka condong ke arah monarki absolut. Alasannya; Tiga bidang di alam semesta: spiritual, gerejawi, dan masyarakat sipil harus merespons model yang sama. Di alam spiritual hanya ada satu yang tertinggi yaitu Tuhan; Pada tingkat gerejawi hanya ada satu otoritas, yaitu Paus; dan dalam masyarakat sipil hanya boleh ada satu penguasa, yaitu raja.
Santo Thomas percaya pada kedaulatan rakyat, yang berarti rakyat adalah otoritas tertinggi dan asal mula kekuasaan dan otoritas. Namun, ketika rakyat secara berdaulat menyerahkan diri, otomatis seorang penguasa menyerahkan kedaulatan yang kini berada pada penguasa yang diakui. Kita di sini menghadapi teori kedaulatan rakyat yang sedang naik daun. Rakyat, rakyat, warga negara, kini berada di bawah kekuasaan tertinggi penguasa, yang menjadi penguasa. Artinya penguasa adalah sumber hak dan hukum. Ketentuan-ketentuannya tidak dapat diajukan banding karena supremasi menurut definisinya.
Secara harafiah, badan sosial berada dalam kekuasaannya karena kekuasaan yang dimilikinya tidak dapat dibantah dan tidak ada pihak di luar atau di atasnya yang dapat mengambil tindakan jika terjadi perselisihan atau penyalahgunaan.
Dalam visi kedaulatan rakyat yang menaik ini, penguasalah yang memandu seluruh kehidupan masyarakat, mengatur segala sesuatu yang berkaitan dengan pencapaian tujuan masyarakat. Dalam salah satu karya kecilnya dikenal sebagai De regimine principum dalam sebagai The Monarchy  Saint Thomas berkata:
Kami memberikan nama raja kepada orang yang menjalankan kekuasaan tertinggi dalam urusan manusia, dan pemerintahannya akan menjadi lebih baik jika diarahkan secara langsung pada tujuan akhir. Oleh karena itu, siapa pun yang mempunyai misi untuk mencapai suatu tujuan mempunyai kewajiban untuk mengatur dan memfasilitasi semua cara yang mengarah pada tujuan tersebut; seperti halnya kapten kapal memberi tahu pemilik kapal bagaimana membangunnya dengan kualitas navigasi yang lebih baik, dan orang yang menggunakan senjata memperingatkan pembuat senjata mana dan jenis apa yang paling nyaman untuk digunakan. Â
