Friedrich Wilhelm Nietzsche  (1844/1900). Hampir semua pemikiran Foucault ditampilkan dalam analisis sejarah , dari karya besar pertamanya  Histoire de la folie  hingga terbarunya  Histoire de la sexualite, melewati sejarah modernitas yaitu Les Mots et les Chooses dan melalui sejarah siksaan dan disiplin yaitu Pengawasan et Punir. Tetapi sejarah Michel Foucault bukanlah sejarah dalam arti istilah tradisional.; mereka bukanlah sejarah representasi atau perilaku. Kadang-kadang, dia bahkan menghindari istilah sejarah dan berbicara, lebih tepatnya, tentang arkeologi dan silsilah: arkeologi pengetahuan (khususnya ilmu manusia), silsilah kekuasaan (kekuatan yang meluruskan tubuh: disiplin; kekuatan yang mengatur populasi: biopolitik). Yang pertama dari konsep-konsep ini telah digunakan oleh Kant dan Husserl untuk mencirikan jenis sejarah pengetahuan tertentu. Yang kedua jelas merupakan akar Nietzschean.
Dalam L'Archeologie du savoir nama Hegel tidak muncul sekali pun; tetapi adalah buta untuk tidak menyadari Foucault berbicara tentang dia ketika dia menandai perbedaan antara arkeologinya dan sejarah gagasan tradisional.. Arkeologi ingin, pada dasarnya, untuk membebaskan diri dari filosofi sejarah dan pertanyaan yang ditimbulkannya: rasionalitas dan teleologi menjadi, kemungkinan menemukan makna laten di masa lalu atau dalam totalitas masa kini yang belum selesai. Terhadap totalitas dan kontinuitas filosofi sejarah, Foucault menentang diskontinuitas dan dispersi.. Untuk melakukan ini, ia akan memalsukan konsep-konsep seperti pernyataan, praktik diskursif, episteme, dll.
Tetapi target Foucault bukanlah Hegel dalam bentuknya yang paling murni, tetapi Hegelianisme Prancis yang oleh beberapa orang disebut hegelisme affole (Hegelianisme menjadi gila), yaitu campuran aneh Hegelianisme dan fenomenologi yang kita ketahui, sebagian besar, di bawah label eksistensialisme. Bukan hanya Hegel dan Husserl, melainkan Sartre dan Merleau Ponty. Karena alasan ini, Foucault menjauhkan diri dari filsafat sejarah dan antropologi. Â Hal ini sebenarnya adalah dua sisi dari mata uang yang sama. Dalam lanskap intelektual ini [Hegelianisme, fenomenologi, eksistensialisme] keputusan saya telah matang: di satu sisi, untuk tidak menjadi sejarawan filsafat seperti guru saya dan, di sisi lain, untuk mencari sesuatu yang sama sekali berbeda dari eksistensialisme: ini adalah pembacaan Bataille dan Blanchot dan, melalui mereka, pembacaan Nietzsche;
Namun, dalam Les Mots et les chooses, dan , meskipun pada tingkat yang lebih rendah, dalam L'Archeologie du savoir, analisisnya terlalu terfokus pada diskursif. Nyatanya, sulit untuk berpikir tentang diskontinuitas dari praktik-praktik diskursif saja; oleh karena itu akan diperlukan  Foucault mengintegrasikan praktik non-diskursif. Maka, penting untuk merujuk pengetahuan dan kekuatan satu sama lain.
Karena kesulitan arkeologi, Nietzsche, dan silsilah ini diubah ukurannya dalam pemikiran Foucault. Dari sini, Nietzsche merepresentasikan referensi filosofis mendasar tentang cara memahami hubungan antara sejarah dan subjek, dan antara sejarah dan kekuasaan.Â
Di dalam Nietzsche memang ada jenis wacana yang membuat analisis historis pembentukan subjek itu sendiri, analisis historis kelahiran jenis pengetahuan tertentu, tanpa pernah mengakui keberadaan subjek pengetahuan sebelumnya. Nietzsche adalah orang yang menempatkan kekuasaan sebagai tujuan esensial dari wacana filosofis. Sedangkan bagi Marx itu adalah relasi produksi. Namun, seperti yang terjadi pada (Heidegger, misalnya), hubungan mendasar ini tidak selalu eksplisit.
Memang, gaya Foucault mengenai penulis fundamental baginya bukanlah urutan kutipan terdokumentasi, tetapi apropriasi. Bagaimanapun, karya Nietzsche menandai Foucault tempat di mana ia berada dalam filsafat. apa yang saya lakukan ada hubungannya dengan filsafat sangat mungkin, terutama sejauh, setidaknya setelah Nietzsche, filsafat memiliki tugas mendiagnosis dan tidak lagi mencoba mengatakan kebenaran yang dapat berlaku untuk semua orang.
Dalam hubungan yang tidak selalu eksplisit antara Foucault dan Nietzsche ini, referensi utama yang  temukan dalam tulisannya adalah tentang topik-topik berikut. Penafsiran.
Presentasi Foucault di Colloque de Royaumont pada Juli 1964 dikhususkan untuk teknik interpretasi dalam Marx, Nietzsche, dan Freud. Di sini Foucault menekankan karakter interpretasi modern yang belum selesai.Dalam Nietzsche  terbukti interpretasi selalu belum selesai. Apa filsafat baginya, jika bukan sejenis filologi yang selalu tegang, filologi tanpa akhir, selalu berkembang lebih jauh, filologi yang tidak akan pernah benar-benar diperbaiki?.  Interpretasi. Silsilah, sejarah. Nietzsche, la genealogie et l'histoire  adalah satu-satunya teks Foucault yang sepenuhnya didedikasikan untuk Nietzsche. Teks ini menimbulkan tiga pertanyaan:
[a] apa bedanya silsilah dengan pencarian asal usul?, [b] hubungan apa  antara silsilah dan sejarah; dan, [c] mungkinkah silsilah sejarah;. Dan kemudian dirumuskan kembali dalam istilah: apa arti arche dalam arkeologi;
Tanggapan Foucault melibatkan menentang penggunaan Nietzsche, di satu sisi, istilah Ursprung (asal) dan, di sisi lain, Herkunft (asal mula) dan Entstehung (munculnya). Pencarian asal usul akan menjadi pencarian esensi yang tepat dari hal-hal dalam identitas mereka yang tidak bergerak. Dengan demikian, sejarah akan menjadi metafisika. Ahli silsilah, di sisi lain, mengarahkan sejarah ke arah yang berlawanan: menuju yang eksternal dan yang kebetulan, menuju perbedaan dan insiden. Dia melihat esensi dari segala sesuatu sebagai topeng: di balik setiap hal ada hal lain atau hal lain. Ahli silsilah meninggalkan, bisa dikatakan, setiap pengerjaan ulang filosofis dari mitos dosa asal.
Dia tidak percaya  pada mulanya, asal-usulnya, hal-hal dalam kesempurnaan mereka (jadi mereka telah keluar dari tangan pencipta) dan  cerita dimulai dengan kejatuhan. Ahli silsilah tidak mencari asal usul. Di tangan satunya,mencari asal: memisahkan identitas (dalam kasus Foucault, terutama dari subjek), meneliti kecelakaan, perhitungan, kesalahan dari mana identitas telah terbentuk dari waktu ke waktu.Â