     Namun dibalik keuntungan dari CBM, ada juga beberapa dampak negatif yang dihasilkan dari pemanfaatan sumber energi baru ini seperti ; limbah air yang dihasilkan pada permukaan air tanah, kualitas udara dan kebisingan pada proses pembangunan infrastruktur penambangan dan pengoboran, cakupan ruang lahan yang relatif memakan banyak tempat dan berimplikasi pada sumber hayati wilayah setempat serta dampak sosial, ekonomi dan budaya masyarakat sekitar.Â
     Berdasarkan dari permasalah tersebut maka diversifikasi dan konversi energi dari CBM harus berlandaskan filosofi konservasi, oleh karena itu dalam kegiatan ekpolarasi, produksi hingga distribusi sumber daya energi baru ini harus dikelola sebaik dan sebijaksana mungkin agar produksi bisa optimal dan lingkungan tetap lestari.
