Presiden Prabowo Subianto bertekad menjadikan Indonesia swasembada pangan  dalam empat tahun ke depan. Program food estate menimbulkan tantangan besar, mengingat kegagalan  berulang kali dari Suharto hingga  Joko Widodo.
Pada masa jabatan Presiden Jokowi, proyek tersebut menyebabkan deforestasi yang meluas dari Sumatera hingga Papua. Di antaranya, program produksi pangan mencakup 770.000 hektar di Kalimantan Tengah, 2 juta hektar di Papua, dan 32.000 hektar di Sumatera Utara.
 Dampaknya bukan pada peningkatan produktivitas pangan, melainkan peningkatan konflik pertanian, kerusakan lingkungan berskala besar, dan bahkan pelanggaran hak asasi manusia.
Proyek ini sebenarnya dimulai sejak tahun 1996 ketika Presiden Suharto mempelopori proyek Pengembangan Lahan Gambut (PLG) Kalimantan Sejuta Hektar. Sayangnya hal itu tidak berhasil dan  kebakaran hutan  terus terjadi selama musim kemarau hingga hari ini.
Kegagalan ini terulang pada tahun 2008 ketika Presiden Susilo Bambang Yudhoyono melaksanakan proyek Merauke Integrated Food and Energy Estate (MIFEE) di Papua. Luasnya mencapai 1,2 juta hektar. Sayangnya, angka kemiskinan  meningkat karena  hutan sagu yang menyediakan makanan bagi masyarakat mulai hilang. Ketika hutan hancur, perburuan menjadi mustahil.
Perkebunan pangan telah dibangun dengan baik di  Papua selama 20 tahun. Sebaliknya, penduduk asli Papua dihukum dengan kelaparan, kemiskinan, dan perampasan tanah  untuk menanam makanan.
Temuan studi FIAN Indonesia menunjukkan bahwa manfaat proyek rekonsiliasi pangan hanya dirasakan oleh kalangan bisnis. Pada saat yang sama, penduduk asli Papua sendiri kehilangan habitat dan hutan sagu mereka.
 Laporan tersebut menemukan bahwa sejak tahun 2010, perkebunan pangan tidak memberikan kontribusi apa pun terhadap pengentasan kemiskinan di tanah yang dirampasnya. Faktanya, konversi lahan secara besar-besaran ini menjadi penyebab utama semakin parahnya permasalahan kemiskinan dan stunting  di Papua.
Menurut data yang disajikan dalam hasil Survei  Gizi Indonesia, angka stunting di Papua 13% lebih tinggi dibandingkan rata-rata  Indonesia. Deforestasi membuat masyarakat kehilangan sumber makanan.
Perkebunan pangan  mengancam keanekaragaman hayati di Indonesia. Misalnya, hutan Papua merupakan rumah bagi beragam flora dan fauna endemik. Papua merupakan rumah bagi sekitar 13.634 spesies, yang mewakili 68% spesies dunia.
Selain itu, habitat orangutan di Kalimantan Tengah dan harimau Sumatera serta beruang madu Malaya di Sumatera Utara juga terancam oleh proyek food estate. Penebangan hutan skala besar untuk perkebunan pangan menghancurkan ekosistem dan keanekaragaman hayati. Hal ini juga menyebabkan perburuan liar spesies langka.
