Berlabuh pada prinsip perang yang adil, orang-orang Spanyol mengorganisir 9.000 tentara yang dipimpin oleh Gubernur Jenderal Jose Malcampo. Pasukan ini dikirim ke Sulu ditemani ratusan imam dan suster. Mereka mengamankan 11 kapal angkut, 11 kapal perang, dan 10 kapal uap. Mereka mendarat di Jolo pada 21 Februari 1876. Sadar akan grand design Spanyol, Sultan Sulu Jamalul Azam mengumpulkan para pemimpin militernya untuk berdiskusi tentang bagaimana menahan jika tidak menggagalkan invasi Spanyol. Sultan memproklamirkan jihad dan memerintahkan penggunaan konsep parrang sabil sebagai jalan terakhir. Rencana bijak sultan terbukti tepat dan efektif. Kesultanan berhasil menegosiasikan perjanjian lain pada 22 Juli 1878, sehingga menyelamatkan rakyatnya dari kehancuran lebih lanjut.
Di front Mindanao, Spanyol sudah berhasil menghancurkan kekuasaan kesultanan Maguindanao. Maranao, Iranun dan kelompok etnis lainnya mulai menggunakan kekuatan masing-masing secara mandiri. Orang-orang ini meluncurkan perang mereka sendiri secara terpisah. Mereka berpisah satu sama lain sampai-sampai Maranao mendirikan kesultanan mereka sendiri karena kesultanan Maguindanao tidak bisa lagi menjalankan kekuasaan pusat atas Mindanao. Selama berabad-abad orang-orang Maranao ini dibayangi oleh Maguindanao. Mereka berperang melawan Spanyol di bawah bendera kesultanan Maguindanao atau kadang-kadang di bawah kesultanan Sulu seperti dalam kasus Iranun. Salah satu perang terbaik yang dipimpin oleh Maranao adalah sikap heroik Datu Amai Pakpak dalam membela Marawi pada tahun 1891 dan 1895. Secara umum, semua kelompok etnis Muslim di Mindanao dan Sulu mendukung perang melawan kolonialisme. Merekalah orang-orang di balik kelangsungan hidup dua kesultanan Sulu dan Maguindanao dalam menghadapi agresi asing. Peperangan panjang ini bahkan disebut sebagai kelanjutan dari Perang Salib, namun bedanya bukan antara Arab dan Romawi melainkan antara Asia dan Eropa.
6. Kolonialisasi Amerika di Filipina
Perang Moro tidak berakhir begitu saja dengan hancurnya kolonialisme Spanyol di Filipina. Orang-orang Spanyol pergi tetapi pasukan kolonial Amerika masuk dan melanjutkan tujuan kolonial yang sama dengan dalih membudayakan penduduk asli. Meskipun kekuasaan kesultanan Sulu menurun, para pejuang di wilayah Tausug yang menentang kehadiran kolonialis kulit putih lainnya, melancarkan serangkaian pertempuran melawan Amerika. Panglima Imam Hassan yang memegang jabatan komandan distrik dari Luuk, Sulu di bawah kesultanan Sulu adalah pemimpin Tausug pertama yang menentang perintah sultan untuk bekerja dengan Amerika untuk kebaikan bersama. Dia tidak bisa diyakinkan dengan keseluruhan misi kolonialisme AS di negara itu. Sebagai Imam, Panglima Hassan memandang kehadiran pasukan AS sebagai ancaman bagi Islam dan masyarakat Muslim. Dia malah melanjutkan rencana militernya dengan memimpin 3.000 prajuritnya yang melawan pasukan Amerika di Jolo pada awal November 1903. Hanya berbekal keris dan beberapa senapan, para prajurit Tausug ini menyerang garnisun musuh yang dilengkapi dengan senjata modern. Setelah satu minggu pengepungan, musuh akhirnya berhasil mematahkan garis pertahanan mereka dan memaksa para pengikut panglima untuk mundur. Meski kalah, aksi militer Hassan mendapatkan simpati yang lebih luas dari massa. Dia berkeliling pulau Sulu mempromosikan perjuangannya menginspirasi para pemimpin lokal untuk melawan kolonialisme AS. Dalam waktu singkat, propaganda Hassan membawa efek positif pada massa Muslim. Amerika digambarkan sebagai musuh Islam; bahwa mereka datang ke tanah Muslim untuk melanjutkan tujuan kolonialisme Spanyol yang belum selesai. Lebih dari itu, umat Islam menjadi khawatir ketika pasukan AS mengibarkan bendera mereka di pusat-pusat utama dan selanjutnya mengharuskan umat Islam untuk mengibarkan bendera AS di kapal mereka. Pada saat yang sama, mereka memperkenalkan sistem pertanahan baru untuk memfasilitasi pengumpulan pajak tanah dari umat Islam. Kebijakan tersebut mengundang kekecewaan dan sikap antagonisme dari masyarakat.
Pada Januari 1906, tiga pemimpin Tausug terkemuka menentang keras kebijakan Amerika dan pendudukan mereka atas tanah Muslim. Mereka adalah Imam Sahirun, Ma'as Abdullatif, dan Panglima Sawadjaan. Para pemimpin ini mengumpulkan 1.000 pengikut mereka dan mendirikan kemah mereka di Bud Dahu sekitar enam kilometer dari Jolo, ibu kota Sulu. Dari sini sebuah kelompok kecil diorganisir dan dikirim untuk menyerang pos-pos militer dan desa-desa yang cenderung mendukung musuh. Orang-orang Amerika menjadi khawatir bahwa oposisi Tausug yang berkembang akan menjadi tidak terkendali. Pada awalnya, mereka mengirim negosiator sipil untuk meyakinkan para pemimpin pemberontak untuk menyerah kepada pemerintah kolonial AS. Para perunding berusaha beberapa kali untuk menyampaikan pesan dari pejabat Amerika tetapi para pemimpin yang menentang berdiri teguh dengan pendirian mereka yang tidak mengakui pemerintah kolonial AS. Oleh karena itu Amerika memutuskan untuk mengambil Bud Dahu dengan paksa.
Pada tanggal 6 Maret 1906, Jenderal Leonard Wood gubernur provinsi Moro, memerintahkan penyerangan terhadap Bud Dahu. Pasukannya terdiri dari 790 orang dan dibagi menjadi tiga kelompok; masing-masing kelompok dituntut untuk menyerang hanya dari tiga lorong sempit menuju perkemahan kaum Muslim. Menggunakan senjata bertenaga tinggi, tentara AS menyerbu benteng Muslim dengan mortir sepanjang sore dan secara bertahap mengambil langkah lebih dekat di malam hari. Kaum Muslim hanya bersenjatakan keris menggunakan pendekatan perang pribumi dengan menggunakan kayu gelondongan yang digulingkan dari atas dimaksudkan untuk menyerang pasukan AS yang maju yang mencoba mendekati lorong sempit dari lereng gunung. Dari akun Muslim, sejumlah besar pasukan AS tewas saat kayu-kayu itu berjatuhan satu demi satu dari puncak gunung. Namun, tentara AS berhasil mencapai puncak gunung. Di pagi hari tanggal 7 Maret 1906, tentara AS menembaki kamp-kamp Muslim dari jarak dekat. Kaum Muslimin bergegas masuk dan bertempur dengan tegas di lapangan terbuka. Hanya enam yang selamat yang berhasil mundur dan melaporkan berita tentang apa yang terjadi dalam apa yang disebut pertempuran Bud Dahu. Hanya beberapa bulan dari pertempuran Bud Dahu, Ma'as Jikiri memimpin kelompok kecil menyerang pos-pos militer Amerika. Dia berjuang selama sekitar tiga tahun sampai mati syahid selama perang melawan tentara AS pada tahun 1909. Sikap heroik Ma'as Jikiri menginspirasi sebangsanya hingga saat ini. Dia adalah satu-satunya pemimpin Tausug yang dalam perang tidak pernah mundur atau melarikan diri di depan musuh bahkan ketika kalah jumlah atau kewalahan. Bahkan tentara Amerika memuji keberaniannya. Ma'as Jikiri adalah satu-satunya musuh asing Amerika yang patungnya kini berdiri di museum Washington.
Semangat perang tidak pernah surut. Itu terus mengeluarkan semangat nasionalis sampai pertempuran besar lainnya meletus -- pertempuran Bud Bagsak pada tahun 1913. Bud Bagsak adalah gunung berukuran sedang dan terletak sekitar 50 kilometer sebelah timur Jolo. Pertempuran ini dipimpin oleh Panglima Amil pemimpin 500 pasukan yang bersembunyi di Bud Bagsak. Perang dimulai pada 9 Juni dan berakhir pada 14 Juni 1913. Semua pejuang Muslim mati syahid dalam pertempuran lima hari melawan tentara AS yang diperlengkapi dengan baik. Kekalahan mereka menandai berakhirnya perlawanan Muslim terorganisir selama 10 tahun pertama kolonialisme AS di Filipina. Episode yang disebut "kris versus krag" hampir berakhir. Ada beberapa pertempuran kecil lagi, tetapi tidak pernah lagi Moro menempatkan kekuatan yang tangguh di lapangan melawan Amerika. Kaum Muslim melakukan pertempuran besar di Bud Bagsak melawan senjata-senjata superior. Penurunan ini membuka jalan bagi penandatanganan Perjanjian Kiram-Carpenter pada 20 Agustus 1915 dimana kedaulatan kesultanan Sulu diambil alih oleh pemerintah kolonial AS. Runtuhnya kesultanan Sulu, pada gilirannya, menyebabkan integrasi Mindanao dan Sulu ke dalam politik kolonial. Sejak saat itu, oposisi umat Islam di Mindanao dan Sulu bergeser dari konfrontasi bersenjata ke gerakan damai dalam bentuk protes dan demonstrasi. Butuh waktu sekitar 14 tahun bagi para pejuang Tausug yang dipimpin oleh Laksamana Usab untuk melakukan pertempuran bersenjata ketika mereka melawan tentara AS di Bud Langkuwasan yang berdekatan dengan Bud Bagsak pada tahun 1927. Usab diangkat sebagai laksamana (pelari) oleh sultan Sulu. Dia berpisah dengan sultan karena dia tidak ingin kebijakan AS di tanah Muslim. Dia mengambil kepemimpinan untuk memerangi kolonialisme AS. Dia mengadakan pertemuan puncak para pemimpin Tausug di Likup, Indanan, Sulu pada awal 1927. Dalam pertemuan itu, semua pemimpin sepakat untuk menyumbangkan pejuang yang datang dari berbagai bagian Sulu dan pulau-pulaunya. Perjuangan Usab memuncak dengan pertempuran Bud Langkuwasan di mana sebagian besar pasukannya termasuk dirinya mati syahid.
