UIN Syarif Hidayatullah didirikan pada 1 Juni 1957, rektornya bernama Prof. Asep Saepudin Jahar, M.A Ph. D. Kampus ini mempunyai  moto "Knowledge, Piety, Integrity (bahasa Indonesia: Pengetahuan, Kesalehan, Integritas)", kampus ini terletak di Jl. Ir. H. Djuanda No. 95, Cempaka Putih, Ciputat Timur, Tangerang Selatan, Banten, Indonesia.
3) Universitas Islam Negeri Sunan Gunung Djati, Bandung
Sejarah berdirinya UIN Sunan Gunung Djati Bandung tidak dapat dipisahkan dari IAIN Sunan Gunung Djati Bandung, karena UIN adalah kelanjutan dan pengembangan dari IAIN tersebut. IAIN Sunan Gunung Djati Bandung didirikan pada tanggal 8 April 1968 M, bertepatan dengan 10 Muharram 1388 H, berdasarkan Keputusan Menteri Agama RI Nomor 56 Tahun 1968. Kehadiran IAIN Sunan Gunung Djati Bandung merupakan hasil perjuangan para tokoh umat Islam Jawa Barat. Pada tahun 1967, sejumlah tokoh masyarakat, alim ulama, dan cendekiawan muslim Jawa Barat, diprakarsai oleh K. H. Anwar Musaddad, K.H. A. Muiz, K.H. R. Sudja'i, dan Arthata, dengan persetujuan gubernur Jawa Barat, membentuk Panitia Perizinan Pendirian IAIN di Jawa Barat. Panitia tersebut kemudian disahkan oleh Menteri Agama RI melalui SK-MA No. 128 Tahun 1967.
Rektor UIN ini bernama Prof. Dr. H. Rosihon Anwar, M.Ag. Universitas Islam Negeri Sunan Gunung Djati Bandung atau dikenal dengan nama UIN Bandung adalah perguruan tinggi negeri berbasis Islam yang terletak di Kecamatan Cibiru, Bandung, Jawa Barat. Nama Sunan Gunung Djati diambil dari nama salah seorang Walisongo, tokoh penyebar agama Islam di Jawa. UIN Bandung menduduki peringkat naisonal PTKIN ke 41.
4) Universitas Islam Negeri Sunan Kalijaga, YogyakartaÂ
Universitas Islam Negeri Sunan Kalijaga Yogyakarta atau sering di sebut dengan UIN SUKA Â adalah salah satu perguruan tinggi Islam negeri di Indonesia yang berlokasi di Jl. Marsda Adisucipto, Yogyakarta, Indonesia 55281. UIN SUKA didirikan pada 26 September 1951.
Sejak tahun 2021, UIN Sunan Kalijaga telah resmi mendapatkan akreditasi Unggul berdasarkan Keputusan Badan Akreditasi Nasional Perguruan Tinggi (BAN-PT) No: 899/SK/BAN-PT/AK-ISK/PT/X/2021 tentang Konversi Peringkat Akreditasi Perguruan Tinggi Universitas Islam Negeri Sunan Kalijaga, Kabupaten Sleman, yang berlaku dari 12 Oktober 2021 hingga 20 Desember 2023. UIN Sunan Kalijaga juga menjadi perguruan tinggi keagamaan Islam pertama yang meraih Akreditasi Unggul dari BAN-PT dan peringkat kedua belas secara nasional.
UIN Sunan Kalijaga adalah lembaga pendidikan tinggi Islam negeri tertua di Indonesia. Pada 14 Oktober 2004, terjadi transformasi dari Institut Agama Islam Negeri (IAIN) Sunan Kalijaga menjadi Universitas Islam Negeri (UIN) Sunan Kalijaga. Saat ini, UIN Sunan Kalijaga menyelenggarakan 69 program studi, yang terdiri dari 44 program sarjana (S1), 19 program magister (S2), 6 program doktor (S3), serta program internasional.
Rektor UIN SUKA bernama Prof. Dr. Phill Al Makin M.A. UIN SUKA menduduki peringkat nasional PTKIN ke 42.
