Namun, dengan kemudahan proses input nilai tersebut menjadi mudah pula untuk direkayasa. Hal tersebut kami buktikan dengan adanya ketidaksamaan antara nilai ujian atau ulangan yang asli dengan nilai di rapot ketika UTS. Seharusnya, nilai berfungsi sebagai bahan acuan untuk melihat kemampuan siswa yang harus di input sesuai dengan kenyataannya.
Permasalahan kedua yang timbul adalah masih seringnya terjadi ketidakhadiran guru dalam kelas. Hal tersebut menjadikan tidak tersampaikannya materi ajar yang sudah tercantum dalam Rancangan Pelaksanaan Pembelajaran. Padahal, guru yang melakukan hal tersebut sudah termasuk dalam guru bersertifikasi. Dimana tujuan dan apa saja yang terdapat dalam program itu seperti sudah kami sebutkan diatas. Dampaknya adalah sering terbengkalainya siswa diakibatkan oleh ketidakhadiran guru. Siswa yang memiliki keinginan untuk belajar seakan di paksa untuk menuruti kepentingan gurunya.
Program sertifikasi sebenarnya sangat baik untuk di aplikasikan dalam sistem pendidikan Indonesia. Dengan program tersebut akan mudah disamakan kualitas mengajar satu guru dengan guru yang lain. Akan tetapi, program yang diniatkan untuk suatu kemajuan itu, tidak akan berhasil tanpa adanya sinergi antara pemerintah sebagai pengatur kebijakan dengan para guru sebagai objek kebijakan. Beberapa solusi yang bisa di lakukan adalah sebagai berikut:
Sosisalisasi Sosialisasi yang dimaksud adalah sosialisasi dari pemerintah pada guru yang sudah berhak mengikuti program sertifikasi. Dalam sosialisasi ini guru diharapkan memahami apa tujuan dan fungsi sertifikasi ini. Kemudia keuntungan yang bisa diperoleh guru atau siswa sendiri.
Pengawasan Pengawasan dilakukan oleh pemerintah pada guru yang sudah mengikuti sertifikasi. Dan diberi survey untuk mengetahui kinerja guru yang sudah mendapat sertifikasi itu sendiri. Selaim itu, pengawasan ini juga bisa berfungsi untuk mengontrol kemampuan guru pada setiap bulannya. Misalkan dengan cara membuat sebuah aplikasi yang didalamnya di beri konten untuk mengevaluasi kemampuan guru. Agar pemerintah bisa memetakan dan mengetahui hasil apa yang diperoleh dari program sertifikasi sendiri.