Di Tekken 2, Heihachi ada by default, dan jika kita mengalahkan Arcade Mode dengan dia, kita dapat membuka Lee Chaolan.
Setelah menangani pengkhiatan anak-anaknya, Heihachi, yang sekali lagi menjadi kepala Mishima Zaibatsu, mendirikan pasukan pribadinya sendiri, Tekken Force. Di saat yang sama, dia mendirikan Mishima Polytechnical School, tempat Jin Kazama menempuh pendidikan secara formal dan bertemu dengan sang kekasih, Ling Xiaoyu, yang sudah Heihachi anggap sebagai cucu perempuannya sendiri. Bahkan Heihachi berjanji kepada Xiaoyu akan membuatkannya taman hiburan.
Selama turnamen kedua, Kazuya telah menawan Nina Williams yang berusaha membunuhnya. Ketika Heihachi mengambil alih Mishima Zaibatsu, Nina dimasukkan ke dalam cryosleep sebagai bahan eksperimen. Sel telur Nina nantinya akan digunakan untuk membuat bayi-bayi yang menjadi bagian dari proyek tentara super. Eksperimen tersebut merenggut nyawa semua anak yang terlibat, kecuali satu (Steve Fox), dan Heihachi menutup eksperimen tersebut karena gagal.
Pula pada masa ini, Heihachi mengerjakan citra Mishima Zaibatsu dan memanfaatkan pasukan Tekken Force untuk menumbuhkan citra kebajikan dengan mengirimkan mereka pada misi kemanusiaan dan penjaga perdamaian. Padahal kenyataannya, Heihachi sedang memburu sumber kekuatan besar yang dikabarkan, makhluk yang hanya dikenal sebagai Ogre. Kepemilikan materi genetik makhluk ini dikabarkan dapat memperpanjang umur dan meningkatkan kekuatan. Heihachi berhasil menemukan makhluk misterius ini, namun setelah membangunkannya di kuilnya di Meksiko, seluruh tim Tekken Force dalam misi tersebut dimusnahkan, dan Ogre hilang.
Sekitar 16 tahun setelah Heihachi menggulingkan Kazuya, seorang anak lelaki berusia 15 tahun muncul di hadapan Heihachi, mengaku sebagai anak Kazuya dan Jun Kazama. Anak itu adalah Jin Kazama. Jin menarik perhatian Heihachi ketika dia mengaku ibunya dibunuh oleh seorang makhluk yang cocok dengan deskripsi Ogre. Pada masa ini, Ogre nampaknya telah memangsa seniman-seniman bela diri seperti King pertama dan Baek Doo San. Memanfaatkan keinginan Jin untuk membalas dendam, Heihachi berusaha melatihnya, berniat menggunakannya untuk memancing Ogre ke tempat terbuka setelah dia cukup kuat.
Selama empat tahun, Heihachi melatih Jin dalam Mishima-style fighting karate, dan keduanya tampaknya memiliki hubungan yang relatif bersahabat selama ini. Heihachi kerap mengajak Jin ikut dalam perjalanan bisnis, termasuk Korea Selatan, dan melatihnya bersama dengan Ling Xiaoyu, sosok yang kemudian akan menjadi cinta dalam hidup Jin. Ketika Jin sudah cukup kuat, Heihachi mengumumkan turnamen King of Iron Fist 3. Ogre muncul dalam turnamen tersebut dan Jin berhasil membunuhnya. Dengan DNA Ogre yang berhasil diamankan dan Jin yang tidak lagi dibutuhkan, Heihachi bertindak berdasarkan kecurigaan bahwa cucunya tersebut mungkin memiliki kecenderungan setan laten seperti ayah dan neneknya. Sebagai tindakan pencegahan, dia menembak Jin.
Peluru mengenai kepala Jin dan pengalaman mendekati fatal tersebut berhasil membangkitkan Gen Iblis dalam tubuhnya. Heihachi diserang oleh Devil Jin, yang kemudian terbang menuju malam.
Di Tekken 3, Heihachi bertindak sebagai sub-boss sebelum mengalahkan bos terakhir, Ogre. Dia dapat dibuka dengan cara mengalahkan Arcade Mode sebanyak tujuh kali dengan karakter berbeda.
Dua tahun sebelum peristiwa di Tekken 4, Heihachi gagal menangkap Ogre, namun peneliti di Mishima Zaibatsu berhasil mengumpulkan sampel darah dan jaringannya. Sebagai imbalannya, sampel-sampel ini digunakan dalam upaya menciptakan wujud baru dengan cara menggabungkan materi genetik Heihachi dan Ogre. Namun, eksperimennya gagal, dan Heihachi mengetahui bahwa dia tidak memiliki Gen Iblis yang diperlukan untuk mengintegrasikan genom Ogre dengan genomnya sendiri.
