 Mereka tidak mengalami perubahan, tetap sama seperti yang kita kenal.
 'Civil War' terjadi saat Donatello menemukan ramuan yang bisa membuat mereka menjadi manusia. Leonardo meminta Donatello merahasiakan hal ini dari Turtles yang lain, sedangkan Michael Angelo (Mikey) menguping pembicaraan mereka dan berniat membuat ramuan itu dengan bantuan Raphael karena mereka sudah bosan hidup sembunyi-sembunyi dan ingin hidup normal layaknya manusia (padahal mereka kan memang bukan manusia XD).
 Jadi pilih team Leo-Donnie atau Mikey-Rap ??????
Shredder (Brian Tee)
 Musuh abadi para Turtles ini kembali dengan rencana baru. Untuk membuka portal dia membutuhkan 3 bagian yang tersebar di seluruh dunia, dan dia melakukan ini karena perintah seseorang.
 Untungnya kali ini penampilannya tidak seperti 'toko pedang berjalan' XD
April O'neil (Megan Fox)
