Setelah Citilink, maskapai penerbangan yang lainnya seperti Lion, Batik air  sedang dalam pengurusan izin untuk mendapatkan izin rute ke JIA.
Semoga  sebelum lebaran tepatnya 10 hari jelang lebaran, YIA  dapat melayani seluruh  ekstra flight sampai 30 flights .
Kereta api bandara :
Warga yang ingin berangkat dari Yogyakarta menuju bandara YIA masih banyak belum mengetahui informasinya bagaimana transportasi umum dari Yogya ke Bandara.
Jika menggunakan taxi akan sangat mahal karena Bandara ini cukup jauh dari pusat kota Yogyakarta yaitu 45. 9 km  atau paling sedikit memakan waktu l jam 16 menit jika tidak macet.
Seiring dengan beroperasinya bandara YIA, maka dibukalah operasi kereta bandara.  Kereta Bandara terdiri atas 4 gerobong dengan rangkai 196 tempat duduk. Pelayanan rute kereta bandara  berangkat dari stasiun Maguwo-Yogyakarta-Wates-Wojo.  .  Kereta berangkat 1 jam sebelum keberangkatan keberangkatan pesawat. Jarak tempuh dari Maguwo ke wojo sektiar 45 menit.
Tarif dari stasiun Maguwo ke Statsion Wojo Rp.30 ribu dengan waktu tempuhnya 45 menit. Â Kereta Bandara itu berkapasitas 196 penumpang duduk dan 98 penumpang berdiri. Â Design kereta juga cukup baik karena ada tempat untuk menempatkan koper atau tas berukuran besar.
Dari Stasion  Wojo, penumpang melanjutkan perjalanan menuju ke bandara YIA  dengan bus Damri dengan jarak 6 kilometer.
Diharapkan nantinya akan beroperasi kereta dari Stasiun Kedundang Kulon Progro yang akan melayani penumpang dari Stasiun Wojo langsung sampai area Bandara Yogyakarta International Aiport tanpa harus naik Damri lagi.
Berikut ini adalah tabel dan foto dari Kereta Api Bandara yang juga sudah diresmikan bersamaan dengan penerbangan perdana di YIA:
