26 Juni 1997
Pembukaan Program Diploma Tiga (D-3) Ilmu-Ilmu Sosial berdasarkan  SK.Rektor UNTAN No. 877/J22/PP/1997 tanggal 26 Juni 1997 untuk 3 Program  Studi (PS): Administrasi Perkantoran, Kesekretariatan, Pekerja Sosial.  Pembukaan Program D-3 ini selanjutnya ditetapkan berdasarkan SK Dirjen  Dikti No.208/DIKTI/Kep/1998.
1998
Pembukaan Program Diploma Tiga (D-3) Budidaya Tanaman Perkebunan pada Fakultas Pertanian UNTAN.
24 Juni 1998
Izin penyelenggaraan Program Studi Magister Manajemen (MM) UNTAN  berdasarkan SK. Dirjen Dikti Nomor 204/DIKTI/KEP/1998, dengan  konsentrasi pada Manajemen Keuangan, Manajemen Sumber Daya Manusia,  Manajemen Pemasaran.
26 April 1999
SK Dirjen Dikti : Nomor 166/DIKTI/KEP/1999 tentang PS. Teknologi Hasil  Hutan; Nomor 167/DIKTI/KEP/1999 tentang PS Sosial Ekonomi Pertanian;  Nomor 173/DIKTI/KEP/1999 tentang PS Budidaya Tanaman Perkebunan
24 Mei 1999
SK Dirjen Dikti Nomor 251/DIKTI/KEP/1999 tentang PS Ilmu Tanah;
27 April 2000
SK Dirjen Dikti Depdiknas Nomor 121/ DIKTI/2000 tentang Pembukaan  Program Strata Dua (S2) Jurusan Ilmu-Ilmu Sosial untuk 2 (dua) Program  Studi (PS): Ilmu Administrasi Negara dan Sosiologi,
22 Desember 2000
Pendirian Fakultas Kehutanan Pada Universitas Tanjungpura, SK Menteri  Pendidikan Nasional Republik Indonesia, Yahya A. Muhaimin, Nomor  238/O/2000 tanggal 22 Desember 2000.
19 Juni 2001
Keputusan Menteri Pendidikan Nasional Republik Indonesia Nomor  095/O/2001 tentang Perubahan atas Keputusan Menteri Pendidikan dan  Kebudayaan Nomor 0171/O/1995 tentang Organisasi dan Tata Kerja  Universitas Tanjungpura. Inti dari keputusan ini adalah perubahan Biro  dari 2 menjadi 3 biro yaitu Biro Administrasi Akademik dan Kemahasiswaan  (BAAK), Biro Administrasi Umum dan Keuangan (BAUK) dan Biro  Administrasi Perencanaan dan Sistem informasi (BAPSI)
4 Juli 2001
Izin Penyelenggaraan Program Studi Ilmu Hukum (S2) pada Untan berdasarkan Surat Dirjen Dikti Depdiknas Nomor 2289 / D / T / 2001
9 November 2001
Izin Penyelenggaraan Program-Program Studi Matematika, Kimia, Biologi  dan Fisika Jenjang Program Strata-1 (S1) berdasarkan surat Dirjen Dikti  Depdiknas Nomor 3494 / D / T / 2001
17 Januari 2002
Pembentukan Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam (Persiapan) berdasarkan Keputusan Rektor Nomor 53/J22/OT/2002