Reklamasi Teluk Jakarta dapat menimbulkan dampak buruk terhadap lingkungan, seperti perubahan ekosistem, pencemaran air, dan kerusakan habitat. Solusi dari sisi spasial untuk mengatasi dampak lingkungan dari reklamasi Teluk Jakarta adalah dengan melakukan pengelolaan lingkungan yang baik dan mengedepankan ketaatan atas hukum yang berlaku. Analisis dampak yang komprehensif atas reklamasi seharusnya dimulai dengan kajian lingkungan hidup strategis untuk menentukan daya dukung dan daya tampung Jakarta dan sekitarnya, termasuk wilayah pesisirnya. Analisis dampak lingkungan, sosial, dan ekonomi juga harus dilakukan berlandaskan Peraturan Pemerintah Nomor 27 Tahun 1999 tentang Amdal dan Peraturan Pemerintah Nomor 27 Tahun 2012 tentang Izin Lingkungan. Pemerintah dapat melakukan pengawasan terhadap pengembang dan memastikan bahwa mereka mematuhi peraturan yang berlaku serta melakukan evaluasi terhadap dampak lingkungan dari proyek reklamasi Teluk Jakarta secara berkala.
