Jika suatu organisasi atau perusahaan memiliki dana yang sedikit, pastinya akan menerapkan sistem MSDI yang tidak sepenuhnya karena sedikitnya finansial. Maka dari itu, perusahaan harus menyediakan dana yang cukup sehingga MSDI dapat berjalan lancar.
3. Budaya organisasi
Budaya organisasi adalah keyakinan dan asumsi dasar yang mengikat kebersamaan setiap anggota organisasi/perusahaan. Budaya perusahaan yang baik akan mempermudah melaksanakan MSDI di dalamnya. Sedangkan perusahaan yang memiliki budaya yang tidak baik, MSDI akan sulit diterapkan di dalamnya.
Budaya perusahaan dapat diciptakan dengan adanya peraturan-peraturan jelek yang perbaharui menjadi aturan-aturan yang baik. Perubahan budaya di dalam perusahaan dapat dimulai dari atasan yang memegang kendali peraturan-peraturan di perusahaan. Pemangku kepentingan perusahaan dapat menjadi contoh yang baik bagi karyawan-karyawannya, sehingga mereka akan mencontoh atasan-atasannya yang sudah menerapkan aturan-aturan yang ada.
4. Struktur organisasi
Struktur organisasi adalah hubungan pelaporan formal, tingkat dan jenis divisi pekerja, serta merupakan alat mengoordinasikan berbagai bagian dalam organisasi. Organisasi yang berbeda ting kat spesialisasi pekerjaannya akan menggunakan hierarki untuk menyelesaikan masalah, bersandar pada kebijakan dan prosedur standar dan menerapkan sistem pengupahan yang mendorong kepatuhan pada kekuasaan. Struktur juga mempengaruhi bentuk dan tingkat motivasi individu, yang selanjutnya akan mempengaruhi berbagai praktek dan program sumber daya manusia. Organisasi tersebut tergantung siapa pemimpinnya. Maka dari itu, pilihlah pemimpin yang benar-benar dapat memimpin.
"Sesungguhnya Allah menyuruh kamu menyampaikan amanat kepada yang berhak menerimanya, dan (menyuruh kamu) apabila menetapkan hukum di antara manusia supaya kamu menetapkan dengan adil. Sesungguhnya Allah memberikan pengajaran yang sebaik-baiknya kepadamu. Sesungguhnya Allah maha mendengar lagi maha melihat. (Qs. An-Nisa: 58)
Itulah beberapa tantangan internal yang kerap mengganggu pelaksanaan MSDI di dalam perusahaan atau organisasi. Maka dari itu, perlu diadakan evaluasi internal untuk menilai seberapa berkembang pelaksanaan MSDI di perusahaan.
