Kurangnya saling pengertian dalam menghadapi masalah perbedaan pendapat.
Para pemeluk agama tidak mampu mengontrol diri, sehingga tidak menghormati bahkan memandang randah agama lain.
Kecurigaan terhadap pihak lain, baik antar umat beragama, intern umat beragama, atau antara umat beragama dengan pemerintah.
Ketika salah satu dari faktor penyebab tersebut terjadi maka permasalahan konflik antar umat beragama seperti di atas akan timbul kembali. Oleh karena itu faktor penyebab masalah kurangnya toleransi antar umat beragama harus diminimalisir atau bahkan di hilangkan dengan beberapa solusi permasalahan.
Solusi permasalah yang cocok untuk masalah konfik antar umat beragama di atas antaralain:
Memberikan kebebasan menjalankan ibadah sesuai dengan agamanya
Saling hormat menghormati dan bekerja sama antar pemeluk agama, antara berbagai golongan agama dan antara umat beragama dengan pemerintah yang sama-sama beritanggung jawab membangun bangsa dan negara
Saling tenggang rasa dengan tidak memaksakan agama kepada orang lain.
Sikap saling mempercayai atas itikad baik golongan agama lain.
Sikap saling menghormati hak orang lain yang menganut ajaran agamanya.
Sikap saling menahan diri terhadap ajaran, keyakinan dan kebiasan kelompok agama lain yang berbeda, yang mungkin berlawanan dengan ajaran, keyakinan dan kebiasaan sendiri.
