Selain berbicara tentang manusia, biologi juga membahas mengenai tumbuhan yang mana pembahasan tersebut mulai dari perkecambahan, morfologi, anatomi, klasifikasi (golongan), serta perkembangan dan reproduksi tumbuhan. Sebagaimana dijelaskan dalam Al-Quran surah Al-An'am ayat 99 yang artinya:Â
"Dan dialah yang menurunkan air hujan dari langit, lalu kami tumbuhkan dengan air itu segala macam tumbuh-tumbuhan Maka kami keluarkan dari tumbuh-tumbuhan itu tanaman yang menghijau."
Baca juga: Filsafat Pendidikan, Ilmu Biologi, dan Agama
Kami keluarkan dari tanaman yang menghijau itu butir yang banyak;dan dari mayang korma mengurai tangkai-tangkai yang menjulai, dan kebun-kebun anggur, dan (kami keluarkan) pula zaitun dan delima yang serupa dan tidak serupa. Perhatikanlah buahnya diwaktu pohon berbuah dan (perhatikan pulalah) kematangannya. Sesungguhnya pada demikian itu ada tanda-tanda (Kekuasaan Allah) bagi orang-orang yang beriman".Â
Dari arti ayat diatas di dalam Tafsir As-Sa'di/Syaikh Abdurrahman bin Nashir as-Sa'di menjelaskan kata "yang serupa" dan "yang  tidak serupa" bisa kembalinya kepada zaitun dan delima, yakni serupa pohon dan daunnya, namun berbeda buahnya.Â
Sehingga dapat dilihat jika dalam biologi maka hal tersebut termasuk dalam subtema tentang klasifikasi tumbuhan (penggolongan) yang mana dapat diketahui bahwa zaitun dan delima termasuk kedalam kelas Magnoliopsida (tumbuhan berkeping dua/dikotil), namun berbeda family pada ziatun termasuk family Oleaceae, sedangkan delima termasuk family Lythracea. Ayat tersebut menjadi salah satu contoh ayat membahas mengenai konsep tumbuhan(botani) dalam biologi.Â
Tak hanya berbicara tentang tumbuhan, Al-Quran juga membahas mengenai hewan/binatang bahkan Allah SWT menanamkan beberapa surah dalam Al-Quran dengan menggunakan nama binatang, seperti Al-Baqarah (Sapi Betina), Al-An'am (binatang ternak), Al-Naml (semut), dan Al-Ankabut (laba-laba). Bukan hanya digunakan sebagai nama surah di Al-Qur'an, tetapi Allah SWT juga menjelaskan sebagimana dalam surah surah An- Nur ayat 45 yang artinya :Â
Baca juga: Belajar Biologi Sambil Berfilsafat
"Dan Allah telah menciptakan semua jenis makhluk yang berjalan di muka bumi ini berasal dari mani, maka sebagian dari makhluk itu ada yang berjalan di atas perutnya, merayap seperti ular, dan sebagian berjalan dengan dua kaki seperti manusia dan burung, sedang sebagian yang lain berjalan dengan empat kaki seperti binatang ternak. Allah menciptakan apa yang Dia kehendaki, baik yang telah disebutkan itu ataupun belum disebutkan, sesungguhnya Allah Maha Kuasa atas segala sesuatu, tiada sesuatupun yang membuat-Nya lemah"Â
Dapat diketahui Ayat diatas membahas bagaimana penciptaan. Jika kita kaitkan dengan pembelajaran biologi maka ini masuk kedalam cabang ilmu biologi yaitu zoologi. Zoologi sendiri cabang ilmu biologi yang membahas mengenai Animalia (hewan). Dimana animalia itu terbagi atas 2 golongan hewan yaitu Invertebrata (hewan yang tidak bertulang belakang) dan vertebrata (hewan yang bertulang belakang).Â
Kebanyakan hewan invertebrata itu berjalan diatas perutnya dan merayap. Sedangkan vertebrata kebanyakan hewan yang mempunyai 2 kaki atau 4 kaki contohnya sapi, burung, dan lain sebagainya.Â