Pada sitoplasma atau daerah antara nukleus dan membran sel, terdapat medium semi cair yang disebut sitosol serta organel-organel sel yang sebagian besar tidak terdapat pada sel prokariotik. Sel eukariotik umumnya berdiameter 10-100 mikrometer.
Struktur sel eukariotik:
 Membran Plasma
Membran plasma merupakan lapisan yang melindungi inti sel dan sitoplasma, membungkus organel-organel yang terdapat di dalam sel. Membran plasma berfungsi sebagai lalu lintas molekul dan ion secara dua arah.Â
Molekul-molekul yang dapat melewati membran plasma adalah molekul hidrofobik (CO2, O2), molekul polar yang sangat kecil (air dan etanol), molekul dengan ukurang yang besar (glukosa), ion, dan substansi hidrofolik membutuhkan mekanisme khusus agar dapat masuk ke dalam sel.
 Sitoplasma
Sitoplasma merupakan cairan kental yang berada diantara membran sel tahanan internal yang semua sel sub-struktur (disebut organel), kecuali untuk inti. Dalamsel eukariotik isi kemudian dari inti sel dipisahkan dari sitoplasma kemudian disebut dengan nucleoplasm tersebut.Â
Pada sel eukariotik juga, sitoplasma mengandung organel, seperti mitokondria, yang diisi dengan cairan yang dipisahkan dari sisa sitoplasma oleh membran biologis.
 Ribosom
Ribosom merupakan struktur terkecil yang bergaris tengah 17-20 mikron, dan terletak di dalam sitoplasma sehingga hanya bisa dilihat dengan bantuan mikroskop elektron. Ribosom bengfungsi untuk menyintetis protein yang selanjutnya akan digunakan untuk pertumbuhan, perkembangbiakan atau perbaikan sel yang rusak. Bahan penyusun ribosom adalah protein ribosomal RNA (rRNA).
Nukleus
