SD Muhammadiyah Karangkajen 2 Yogyakarta dengan sekolah pembentukan karakter. Pembentukan Karakter siswa siswi SD Muhammadiyah Karangkajen 2 bukan sekedar mengajarkan atau memberikan pengetahuan tentang baik dan buruk melainkan melakukan proses membiasakan, menyontohkan, melatihkan, menanamkan, Â mendarahdagingkan sifat-sifat yang baik, dan menjauhi perbuatan yang buruk. Proses pendidikan karakter perlu dilakukan sejak dini dan sudah harus dimaksimalkan pada usia sekolah dasar. Oleh karena itu, pendidikan karakter merupakan pendidikan yang dinilai sangat penting untuk ditanamkan pada anak-anak usia sekolah dasar (SD).
Saat ini di SD Muhammadiyah Karangkajen 2 Yogyakarta mempunyai cara-cara tersendiri dalam memberikan pendidikan karakter. Berikut kegiatan yang di lakukan untuk menumbuhkan karakter siswa siswi SD Muhammadiyah Karangkajen 2 Yogyakarta:
1. Pembiasaan Hafalan Al Qur'an Setiap Pagi
Salah satu kegiatan nyata dilakukan di SD Muhammadiyah Karangkajen 2 Yogyakarta  adalah dengan menghafal Al Qur'an sebelum kegiatan pembelajaran di mulai. Kegiatan tersebut di lakukan karna sekolah berupaya untuk membentuk karakter religius yang tinggi sebagai pondasi bekal anak didik di masa mendatang.Â
Dengan adanya hafalan tersebut harapannya siswa sisiwi dapat termotivasi untuk membaca pembiasaan membaca dan cinta terhadap Al- Qur'an. Sebagaimana Wahyu pertama yang diturunkan kepada Nabi Muhammad SAW yaitu Surah Al-Alaq ayat : 1. Ayat ini mengajarkan kita untuk membacaÂ
"Bacalah dengan (menyebut) nama Tuhanmu yang menciptakan"
2. Budaya Salam Setiap Pagi
Peran guru sangatlah beragam, selain memberikan pengetahuan kepada siswa guru juga berperan dan bertanggung jawab dalam membimbing siswa untuk berakhlak mulia. Karakter berbudi pekerti dan nilai-nilai kehidupan dapat ditanamkan kepada siswa di mana saja dan kapan saja. Salah satu kegiatan yang dilaksanakan di SD Muhammadiyah Karangkajen 2 Yogyakarta dalam penanaman karakter ini melalui penyambutan siswa di pagi hari.Â