Zak jadi menyadari kehidupan para peri setelah masuk menjadi komunitas itu. Bersama-sama, mereka mengumpulkan para peri dan hewan di hutan hujan untuk melindungi rumah mereka dari para penebang dan Hexxus, entitas polusi yang jahat.
Hexxus bertekad untuk membalas dendam kepada para peri FernGully (khususnya Magi Lune) karena sudah memenjarakannya. Asap yang dihasilkan mesin The Leveler ini memberikan semacam energi terhadap Hexxus.
Kerusakan alam dalam animasi FernGully: The Last Rainforest ini relate banget dengan apa yang dialami Indonesia, karena tempat yang sama-sama hutan Hujan Tropis dan kerusakan alam yang menghasilkan asap. Baru-baru ini muncul berita, asap dari hutan Indonesia akibat Karhutla sampai Singapore dan Malaysia.
Sangat disayangkan dan miris, atas kejadian ini mari kita jaga alam kita.
Alam akan memberikan pesannya, "Tidak ada asap kalau tidak ada api", petuah ini sangat pantas untuk kejadian. Sebagai wilayah yang dianugerahi hutan hujan tropis, yang kaya tingkat biodiversity dan menyandang predikat " Paru-Paru Dunia", sudah saatnya kita "Save alam Indonesia ", untuk keberlangsungan kita dan anak-cucu kita di masa depan nanti.
