Mempelajari sains fisika, kimia, biologi dan matematika dalam perspektif alQuran, menjadi bagian yang terpenting juga guna lebih jauh mengungkap rahasia Al-Quran berdasarkan telaah mendalam terhadap Al-Quran, yang hanya bisa di dapat melalui cara mempelajari dan mendalami bahasa Arab, sebagai alat menelusuri rahasia Al-Quran dari berbagai kitab klasik. Disamping kebutuhan pendukung, seperti filsafat sebagai nalar dalam banyak hal berdasarkan fakta fakta ilmiah.
Menurutnya, Trensains Islam Muhammadiyah lebih pada mewacanakan Islam berdasarkan ilmu ilmu sain, yang beda dengan Trans Islam nasional yang hanya menggagas ide ide kontroversial di tengah masyarakat Islam. apalagi Trensain Muhammadiyah adalah satu satunya di dunia yang diprakarsai Dr. Agus Purwanto .
