Sebelum menjadi desa definitif, Desa Kalijaga Baru merupakan bagian dari wilayah Desa Kalijaga Selatan. Desa Kalijaga Selatan dimekarkan menjadi 3 (Tiga) desa, yakni Desa Kalijaga Selatan selaku desa induk, serta Desa Sukarema dan Desa Kalijaga Baru sebagai desa hasil pemekaran.
Desa Kalijaga Baru sendiri memisahkan diri dari desa induk  (Desa Kalijaga Selatan) pada akhir tahun 2010 dan menjadi Desa Persiapan Kalijaga Baru dengan menunjuk dan menyetujui H. Usman, S.Pd.I selaku Pejabat Sementara (PJS) Kepala Desa Persiapan Kalijaga Baru.
Wilayah Desa Persiapan Kalijaga Baru dibagi menjadi 6 (enam) dusun yakni Dusun Tabiin, Dusun Lendang Bunga Utara, Dusun Lendang Bunga, Dusun Lendang Embur, Dusun Lendang Bunga Selatan, Dusun Lendang Kantong Selatan. Dan masing-masing dusun dipimpin oleh Kepala Dusun. Â
Luas wilayah Desa Kalijaga Baru sebesar + 189, 11 Ha. Desa Kalijaga Baru terdiri dari 6 dusun dan 28 RT. Topografi Desa Kalijaga Baru secara keseluruhan merupakan dataran tinggi yang terletak di sebelah selatan Kecamatan Lenek Kabupaten Lombok Timur Provinsi Nusa Tenggara Barat, beralamat di Jl. Kalpataru Lendang Bunga Utara, kode pos 83653. Dengan Jarak Tempuh Ke Kecamatan sepanjang 7 Â km. Desa Kalijaga Baru dengan jarak tempuh ke Ibu kota Kabupaten Lombok Timur 15 km.
Jumlah penduduk Desa Kalijaga Baru sebanyak 3.646 jiwa dengan jumlah rumah tangga 1.339 Kepala Keluarga. Jumlah penduduk perempuan 1.895 jiwa, sedangkan penduduk laki-laki 1.751 jiwa, kemajuan kecukupan kebutuhan pokok (sandang, pangan, papan) sedangkan mata pencaharian sebagian penduduk adalah petani dan beternak, kemudian hasil produksi ekonomi desa yang menonjol adalah padi dan jagung.
