Dikisahkan, BoBoiBoy harus menghadapi tokoh jahat dari masa lalu, Retak'ka yang ingin merebut kembali kekuatan elemental yang dulu pernah dimilikinya sebelum terkurung membeku selama 100 tahun. Demi mendapatkan kembali kekuatan tersebut, Retak'ka menghancurkan stasiun angkasa TAPOPS dan menyerang beberapa galaksi.
Atas perintah Komander Koko Chi, BoBoiBoy yang dua kekuatannya telah diserap Retak'ka kemudian menemui Hang Kasa untuk berguru. Ternyata Hang Kasa adalah kawan lama Retak'ka yang dulu memenjarakannya dalam kristal es sebelum dibebaskan oleh para pencari kristal.
Hang Kasa ternyata juga punya misi untuk mengalahkan Retak'ka seorang diri dengan merebut kekuatan gempa dari BoBoiBoy. Singkat cerita, Hang Kasa harus kalah oleh Retak'ka yang semakin kuat. Jadilah BoBoiBoy kembali bertarung menghadapi Retak'ka. Dan endingnya tentu sudah bisa ditebak.
Agar tak terlalu banyak spoiler, saya tak akan menjelaskan bagaimana Retak'ka dikalahkan oleh BoBoiBoy. Yang jelas, dengan cara yang terhormat kebenaran akhirnya mengalahkan kejahatan dan BoBoiBoy mendapatkan kembali semua kekuatan elementalnya.
Alur cerita di film ini sebenarnya bisa dibilang kompleks dengan beberapa scene throwback yang mungkin agak membingungkan.Â
Tapi dengan visualisasi menarik dan dialog yang masih bisa dimengerti anak-anak zaman sekarang, terlebih mereka yang lebih dulu akrab dengan Upin-Ipin, film ini bisa dengan mudah dipahami dan dinikmati oleh anak-anak sekalipun.
Sebagai karya cipta audio visual, film animasi produksi negara tetangga ini sangat patut bahkan sudah seharusnya mendapat apresiasi tinggi.Â
Openingnya sudah membuat penonton tercengang, terlebih pada adegan BoBoiBoy dan Gopal dikejar monster raksasa saat menyelamatkan Eggabot.
Demikian pula aksi BoBoiBoy dengan kekuatan elementalnya saat bertarung melawan Retak'ka sungguh mengasyikkan untuk disimak.
 Meskipun bukan film live action, adegan perkelahian yang dikemas dengan kecanggihan teknologi animasi membuatnya jadi semakin mendebarkan untuk disaksikan di layar lebar.
Sangat jelas jika film ini benar-benar digarap dengan serius sehingga hasilnya berkualitas. Aspek grafis, sinematografi dan tata suara serta musik pendukung bisa dibilang istimewa untuk ukuran film Asia, bahkan menurut saya sudah bisa menyamai film-film animasi 3D produksi Disney.
