Pemerintah telah dituduh melakukan pelanggaran HAM termasuk penyiksaan, pembunuhan di luar hukum dan penangkapan dengan motif politik. Wenda mengklaim dia ada di antara mereka. Pria 46 tahun itu telah terlibat dalam aktivisme pro-kemerdekaan selama beberapa dekade. Dia melarikan diri ke Inggris, kemudian melanjutkan advokasi internasional untuk kemerdekaan, setelah melarikan diri dari penjara pada tahun 2002, wenda menghadapi dakwaan karena menghasut serangan ke kantor polisi di mana dia menyangkal keterlibatannya.
Ketimpangan ekonomi adalah poin perdebatan lainnya. Papua memiliki sumber daya yang melimpah --- kaya kayu dan rumah bagi tambang emas terbesar di dunia dan tambang tembaga terbesar ketiga --- tetapi merupakan salah satu daerah termiskin di Indonesia, negara dengan populasi terpadat di Asia Tenggara dan ekonomi terbesar. Sekitar seperempat penduduk Papua hidup di bawah garis kemiskinan. Kerusakan lingkungan, yang sering dikaitkan dengan eksploitasi sumber daya, adalah keluhan lain (Wenda mengatakan jika merdeka, Papua akan menjadi "Negara Hijau" pertama di dunia.)
"Orang-orang kami telah terbunuh, gunung kami telah dihancurkan, hutan kami telah dihancurkan," kata Wenda.
Ketegangan telah meningkat. Kerusuhan tahun 2019 terjadi di Papua setelah polisi di Jawa dilaporkan menyebut nama rasis kelompok pelajar Papua seperti "monyet". Setidaknya 43 orang tewas, termasuk setidaknya satu tentara Indonesia, menurut Human Rights Watch. Lebih dari 6.000 tentara dikerahkan untuk memadamkan kerusuhan.
Pemerintah telah berkomitmen miliaran dolar untuk proyek infrastruktur di wilayah tersebut, dan mengatakan fokus pada pembangunan di sana. Hal Ini telah menimbulkan beberapa perlawanan, dan menyebabkan bentrokan; misalnya, sebagian orang Papua takut bahwa jalan yang dibangun melintasi wilayah tersebut akan memudahkan militer Indonesia untuk mengakses dan membukanya untuk eksploitasi sumber daya.
"Ada laporan berulang tentang pembunuhan di luar hukum, penggunaan kekerasan yang berlebihan, penangkapan dan pelecehan dan intimidasi terus menerus terhadap pengunjuk rasa dan pembela hak asasi manusia," kata pernyataan PBB itu.
Juru bicara Kementerian Luar Negeri Indonesia Teuku Faizasyah mengkritik pernyataan itu, termasuk rilisnya sehari sebelum 1 Desember, yang dianggap oleh orang-orang di West Papua sebagai hari kemerdekaannya, dengan mengatakan pernyataan tersebut dapat ditafsirkan sebagai dukungan untuk separatis Papua.
Dalam sebuah pernyataan, Wakil Kepala Staf Presiden Jaleswari Pramodawardhani tidak secara langsung menyinggung soal dugaan pelanggaran HAM tersebut. Namun, Pramodawardhani mengatakan kepada CNN bahwa "proses penegakan hukum sedang berlangsung saat ini" dan bahwa pemerintah telah "memulai pembentukan tim pencari fakta untuk mempercepat proses penegakan hukum" yang mencakup pemerintah dan otoritas penegak hukum, dan perwakilan independen dari komunitas akademik, dan masyarakat sipil.
Beberapa ahli memperingatkan bahwa pengumuman Wenda dapat memperburuk ketegangan. Richard Chauvel, seorang profesor di Institut Asia Universitas Melbourne, mengatakan pembentukan 'pemerintahan yang sedang menunggu' di West Papua dapat memaksa Indonesia untuk mengirim lebih banyak pasukan ke daerah yang sudah menjadi wilayah yang terkurung dengan ketat.