Kemudian dia memimpin misi menembus blokade Belanda guna menyelundupkan senjata, bahan pangan, dan lainnya. Daerah operasinya meliputi Singapura, Penang, Bangkok, Rangoon, Manila, dan New Delhi.
Menurut kesaksian Jenderal Besar TNI AH. Nasution pada 1988, prestasi John Lie "tiada taranya di Angkatan Laut" karena dia adalah "panglima armada (TNI AL) pada puncak-puncak krisis eksistensi Republik", yakni dalam operasi-operasi menumpas kelompok separatis Republik Maluku Selatan, Pemerintahan Revolusioner Republik Indonesia, dan Perjuangan Rakyat Semesta.
John Lie wafat pada 27 Agustus 1988. Beliau dikebumikan di Taman Makam Pahlawan Kalibata, Jakarta. Atas segala jasa dan pengabdiannya, ia dianugerahi Bintang Mahaputera Utama oleh Presiden Soeharto pada 10 November 1995, Bintang Mahaputera Adipradana dan gelar Pahlawan Nasional oleh Presiden Susilo Bambang Yudhoyono pada 9 November 2009.
Akan sangat menarik bila suatu ketika ada film biopik yang mengulas kiprah beliau bagi Indonesia. Pasti akan  mampu menyadarkan kita bahwa perjuangan meraih dan mempertahankan kemerdekaan dilakukan oleh segenap WNI, dari aneka agama, suku, dan ras.
Nama-Nama Perwira TNI dan Polri dari Etnis Tionghoa
Dalam sejarah TNI dan Polri, tercatat ada sejumlah petinggi yang berasal dari etnis Tionghoa. Beberapa nama berikut semoga bisa memberi gambaran:
Brigadir Jenderal TNI Teguh Santosa atau Tan Tiong Hiem (jabatan terakhir Wakil Asisten Perencanaan Kepala Staf Angkatan Darat tahun 1993-1995)
2. Mayor Jenderal TNI Iskandar Kamil atau Liem Key Ho (jabatan terakhir adalah hakim agung).
3. Brigadir Jenderal TNI Teddy Yusuf atau Him Tek Ji (anggota Fraksi ABRI di Dewan Perwakilan Rakyat tahun 1995-1999)
4. Marsekal Pertama TNI Ir Billy Tunas, MSc (Kepala Pusat Data dan Informasi Departemen Pertahanan tahun 1992-1993)
5. Brigadir Jenderal TNI Paulus Prananto (jabatan terakhirnya adalah Kepala Pusat Data dan Informasi Departemen Pertahanan tahun 1999-2002)
6. Laksamana Pertama TNI FX Indarto Iskandar atau Siong Ing (Kepala Biro Perencanaan Sekretariat Jenderal Departemen Pertahanan)
7. Mayjen TNI dr Daniel Tjen, SpS (Kepala Pusat Kesehatan TNI).
8. Kolonel Surya Margono atau Chen Ke Cheng (Atase Pertahanan di KBRI Beijing, Tiongkok).
Baca Juga:Â Liem Koen Hian, Tokoh Wartawan, dan Politisi Tionghoa
Icha Ong, Brimob Jelita yang Sempat Viral
Salah satu nama yang sempat tenar adalah Icha Ong. Nama lengkapnya Trizha Valencia Ong. Polwan dari latar-belakang etnis Tionghoa ini anggota Brigade Mobil Kepolisian Daerah Sulawesi Utara.
Dalam informasi bio di Instagramnya @ong_icha, dia memperkenalkan diri sebagai Buci alias "Bugis-Cina". Jumlah pengikutnya tak tanggung-tanggung: 73 ribu.Â